基于RNA测序的尼古丁影响下大鼠前额叶皮质的基因表达分析
张莉华1
李明定2
王举3
1.天津医科大学生物医学工程学院 3000702.美国弗吉尼亚大学医学院3.天津医科大学生物医学工程学院 300070; 美国弗吉尼亚大学医学院
摘要：目的：研究尼古丁处理对大鼠前额叶皮质（PFC）中基因表达的影响。方法24只F344大鼠随机分为实验组和对照组，每组12只，分别注射尼古丁水溶液或生理盐水17 d。药物处理结束后，从每只大鼠大脑采集PFC组织。然后采用RNA测序（RNA-Seq）技术对24只大鼠大脑PFC区域的mRNA进行测序，测出的读段利用Bowtie、Tophat及Cufflinks等生物信息学工具比对到参考基因组上并测量转录子表达水平。随后采用统计学方法确定表达水平在实验组和对照组发生显著变化的基因，并进一步分析了这些基因的功能类别及与其相关的生化通路。结果通过分析每个转录子在处理组和对照组的表达水平，确定了在尼古丁影响下的表达水平发生显著变化的基因885个。在这些基因中，与多个Gene Ontology生物学过程如G蛋白偶联受体信号通路、蛋白质泛素化和神经递质吸收等，以及生化通路如胰岛素信号、阿尔茨海默病和长时程增强等相关的基因均显著富集。结论尼古丁处理可能调节大脑PFC区域神经信号传导和能量代谢等生物学过程。
关键词：尼古丁神经系统前额叶皮质序列分析RNA基因表达信号传导能量代谢大鼠近交F344
分类号：R742(神经病学与精神病学)R332(人体生理学)
资助基金：国家自然科学基金(31271411)
论文发表日期：2014-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 47-50 )
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