DOI: 10.11958/20170801
基于TCGA数据集探讨FAT2基因在上皮性卵巢癌中的作用及机制
翟惠惠1
赵洪波2
张琴1
杨丽华1
1.昆明医科大学第二附属医院妇科 6501012.昆明医科大学
摘要：目的 基于肿瘤基因图谱(TCGA)数据集研究脂肪非典型钙黏蛋白2(FAT2)基因在卵巢癌中的表达情况,预测并分析FAT2在卵巢癌发生发展中的可能机制及临床价值.方法 应用cbioprotal在线分析平台分析TCGA数据库中311例上皮性卵巢癌RNA-SEQ数据,并结合患者的完整生存期信息,采用Kaplan-Meier法分析FAT2变异与卵巢癌患者生存之间的关系.应用genecards数据库收集与FAT2基因相关的蛋白,绘制FAT2相关蛋白网络图,对相关蛋白进行富集分析,分析蛋白富集的信号通路、生理过程及关键下游基因.结果 311例卵巢癌样本中有12例发生FAT2基因变异,变异率为4%,扩增7例(2.3%),错义突变3例(1%),缺失2例(0.6%).Kaplan-Meier生存曲线分析表明,FAT2变异组总生存时间长于无变异组(P=0.0338),无病生存时间与无变异组差异无统计学意义(P=0.387).与FAT2相关的蛋白有CTNNB1、ARVCF、CTNND1等21个,其中CTNNB1蛋白在卵巢癌中低表达,相关蛋白富集分析到Wnt信号通路、细胞黏附等细胞生理活动.结论 FAT2基因可能可通过诱导Wnt通路中的关键蛋白CTNNB1降解发挥抑癌基因的作用.卵巢癌组织中FAT2高表达是一种预后良好指标,可作为预测患者生存时间,判断预后的有效生物标志物.
关键词：卵巢肿瘤上皮性卵巢癌FAT2Wnt信号通路cbioprotalgenecards
分类号：R737.31(泌尿生殖器肿瘤)
资助基金：云南省医学学科带头人培养项目(D-201633)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 1289-1292 )
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