DOI: 10.11958/20193350
基于转录组测序的EV71感染RD细胞的基因表达变化研究
程凯
曹丽
张鑫艳
郝晋芳
张晓延
1.山西医科大学汾阳学院医学检验系 0322002.山西医科大学汾阳学院医学检验系 0322003.山西医科大学汾阳学院医学检验系 0322004.山西医科大学汾阳学院医学检验系 0322005.山西医科大学汾阳学院医学检验系 032200
摘要：目的 基于转录组测序技术探讨肠道病毒71型(EV71)感染对人横纹肌肉瘤(RD)细胞自噬和免疫的影响及其作用机制.方法 用不同剂量EV71感染RD细胞确定感染复数(MOI).在MOI=1时选择不同时间点(0、0.5、1、1.5、3、6、9和12 h)共8组进行后续实验.倒置显微镜观察细胞形态和数量变化;蛋白免疫印迹(Western blot)检测蛋白表达情况;运用转录组测序技术分析细胞功能及基因表达的变化;高内涵细胞成像技术观察细胞内蛋白表达情况.结果 倒置显微镜可见细胞在病毒感染3h由梭形贴壁逐渐变为圆形悬浮,细胞数量相比0h明显减少(P<0.05).Western blot结果 显示细胞在感染后6 h、9 h、12 h,病毒在RD细胞内已经表达病毒衣壳蛋白1(VP-1),感染后9 h自噬相关蛋白LC-3Ⅱ/LC-3Ⅰ与0 h组相比明显升高(P<0.01).转录组测序结果 显示EV71感染RD细胞后3 h细胞内基因表达变化达到峰值,上调基因1199个,下调基因126个.KEGG分析提示改变的信号通路分子大多与自噬和免疫相关.高内涵细胞成像显示细胞在感染后数量减少,细胞内自噬蛋白平均荧光强度增加(P<0.05).结论 EV71感染RD细胞通过自噬相关信号通路促进病毒在细胞内完成复制和组装.
关键词：肠道病毒A型人转录组基因表达自噬横纹肌肉瘤细胞免疫应答
分类号：R373.2(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)R349.64(基础医学)
资助基金：国家自然科学基金(81301426)山西医科大学汾阳学院科技发展基金(2018B04)山西省高等学校大学生创新创业训练计划(2018813)
论文发表日期：2020-08-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 689-694 )
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