DOI: 10.11958/20240587
基于RNA测序和生物信息学分析鉴定椎旁肌退变中关键的铁死亡基因
张春虹1
黄洪超1
刘越1
杜立龙1
许海委1
黎宁1
李勇进2
1.天津市天津医院微创脊柱外科(邮编 300211)2.中国科学技术大学附属第一医院脊柱外科
摘要：目的 探究椎旁肌退变(PMD)中的基因表达谱,并鉴定关键的铁死亡基因.方法 选取正常和PMD患者各3例,分别取椎旁肌组织进行RNA测序,获得差异表达的基因.通过蛋白-蛋白相互作用(PPI)和基因功能富集分析,与铁死亡基因取交集,鉴定与铁死亡相关的关键中枢基因.通过受试者工作特征(ROC)曲线分析铁死亡基因对PMD疾病的诊断价值.结果 在PMD中共鉴定出292个差异表达的基因,其中125个显著下调,167个显著上调.生物信息学分析发现14个差异表达的基因与铁死亡相关,其中铁死亡基因MUC1、ATF3、CDKN1A是关键的中枢基因,对诊断PMD具有良好的敏感度和特异度.功能富集分析发现它们可能通过调控细胞凋亡、铁死亡和骨骼肌组织发育、分化等介导PMD的发生与进展.结论 铁死亡基因MUC1、ATF3、CDKN1A可作为诊断PMD的生物标志物,为解码PMD的病理机制及开发新的药物提供理论依据.
关键词：序列分析RNA铁死亡计算生物学椎旁肌退变
分类号：R685(骨科学（运动系疾病、矫形外科学）)
资助基金：天津市卫生健康委员会科技项目(TJWJ2023QN052)
论文发表日期：2024-09-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 991-995 )
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