髓样分化蛋白-2与脂多糖结合的模拟小肽的分子设计
闫红1
顾长国2
徐发良2
胡承香2
葛衡江2
李磊2
1.解放军第三军医大学大坪医院野战外科研究所,麻醉科,重庆市,4000422.解放军第三军医大学大坪医院野战外科研究所,第一研究室,重庆市,400042
摘要：目的:利用生物信息学原理,设计针对髓样分化蛋白-2的与脂多糖结合的模拟小肽,为研制具有抗炎效应的髓样分化蛋白-2拮抗多肽奠定基础.方法:实验于2004-01/12在第三军医大学野战外科研究所第一研究室完成.采用Goldkey核酸和蛋白质分析软件及核酸和蛋白质数据光盘、PC/Gene软件系统;EMBL提供的PRS服务器、NCBI提供的BLAST服务器及Superfamily等互联网服务器,分析髓样分化蛋白-2的氨基酸序列,预测髓样分化蛋白-2的新功能,寻找髓样分化蛋白-2与脂多糖结合的关键位点.结果:①髓样分化蛋白-2的氨基酸序列功能位点信息:在96～141位氨基酸具有多达5个的功能位点.②髓样分化蛋白-2的Superfamily超家族预测:K128和K132是与脂多糖结合域的关键氨基酸,以K128-K132为中心的肽段呈现较强的亲水性,即NH2-FSKGKYKCV-COOH.结论:如果人工合成髓样分化蛋白-2与脂多糖结合域的关键序列,即"髓样分化蛋白-2模拟小肽",并以此段多肽为靶,采用噬菌体随机肽库筛选,可望得到天然髓样分化蛋白-2的拮抗多肽.
关键词：分子生物学序列分析分子构象肽库
分类号：R318.04(医用一般科学)
资助基金：科技部科研项目(G1999054203)
论文发表日期：2005-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 26-28 )
英文信息