不同分化程度卵巢癌细胞中胚胎干细胞相关通路的基因集富集分析
叶云1
王桂平2
杨晓勤3
尹曦3
梁爽3
郑文岭3
马文丽3
1.南方医科大学基因工程研究所,广东省广州市,510515;广西工学院生物与化学工程系,广西壮族自治区柳州市,5450062.南方医科大学基因工程研究所,广东省广州市,510515;广州医学院护理学院,广东省广州市,5101823.南方医科大学基因工程研究所,广东省广州市,510515
摘要：背景:近年来一些研究发现肿瘤细胞具有与干细胞类似的特征,因此,控制干细胞功能的某些基因调控网络,可能也在某些f肿瘤中同样发挥作用.目的:观察不同分化程度卵巢癌的分子特征,获得与胚胎干细胞相关基因的表达情况.方法:从美国国立生物信息中心(NCBI)共享数据库GEO下载原始基因芯片文件,登录号为GSE2109,选取卵巢癌样本作为研究材料.去除临床指标缺失的样本,按照组织学分级将卵巢癌样本分为高分化和低分化两组.原始数据经dChip进行质量检验和标准化,获得基因表达的矩阵.收集胚胎干细胞相关的基因集、生物学过程和KEGG通路在不同分化的卵巢癌中的富集情况,用GSEA进行基因集富集分析. 结果与结论:选取了13个与胚胎干细胞相关的基因集,低分化的卵巢癌细胞中有9个基因集上调,PR02靶点相关的4个基因集下调,说明与胚胎干细胞相关的基因集大多在低分化的卵巢癌细胞中上调.并且在低分化卵巢癌细胞显著上调的都是与细胞周期、细胞分裂、DNA复制等与增殖相关的通路.基因表达谱分析表明低分化的卵巢癌与胚胎干细胞具有相似的分子特征,这可以为卵巢癌的早期诊断和治疗提供新的思路.
关键词：表达谱胚胎干细胞分化卵巢癌基因通路富集基因集
分类号：R394.2(医学遗传学)
资助基金：广东省生物芯片重点实验室基金(2004B60144)
论文发表日期：2010-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 5006-5009 )
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