骨质疏松症蛋白质相互作用网络的构建和分子复合物通路预测
张治国1
牛旭艳2
刘梅洁1
李艳1
吕爱平2
鞠大宏1
1.中国中医科学院,中医基础理论研究所,北京市,1007002.中国中医科学院,中医临床基础医学研究所,北京市,100700
摘要：背景:在蛋白质相互作用网络的基础上研究骨质疏松症,可以更深入全面了解其发生发展机制.目的:建立基于骨质疏松症遗传相关基因的蛋白质相互作用网络,对其中所含分子复合物涉及的生物学通路进行预测.方法:筛选在线人类孟德尔遗传数据库中的骨质疏松症遗传相关基因,应用Cytoscape 软件和插件Agilent Literature Search,进行文本挖掘并建立骨质疏松症的蛋白质相互作用网络;应用插件Clusterviz,发现网络中的可能包含的分子复合物;基于DAVID,富集分子复合物的生物学通路.结果与结论:人类孟德尔遗传数据库中骨质疏松遗传相关基因有177 个.骨质疏松症的蛋白质相互作用网络包含863 个节点(蛋白质)、2 925 条边(相互作用关系),可能包含4 个分子复合物.其中分子复合物3 涉及免疫细胞表面分子及其相互黏附、细胞因子与其受体的结合、造血和止血功能等生物学通路;分子复合物4 与糖尿病的发生有一定关系.
关键词：蛋白质相互作用网络骨质疏松症在线人类孟德尔遗传数据库分子复合物通路
分类号：R318(医用一般科学)
资助基金：国家自然科学基金(30973691)中国博士后科学基金(20100470524)
论文发表日期：2011-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 6090-6094 )
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