干细胞调控因子神经系统多梳蛋白1的全基因组范围结合靶点分析
李辉1
刘媛2
龚燕华3
1.武警后勤学院组织学与胚胎学教研室,天津市,3001622.中国医学科学院基础医学研究所,北京市,1000053.中国医学科学院基础医学研究所,北京市,100005;武警后勤学院生物化学与分子生物学教研室,天津市,300162
摘要：背景:在胚胎发育早期神经系统高表达的多梳蛋白家族成员神经系统多梳蛋白1具有明确转录抑制作用.最近研究表明,神经系统多梳蛋白1可能是一个有别于同源基因Bmi1的新的神经干细胞调控因子.目的:检测体外神经细胞分化模型小鼠畸胎瘤P19细胞中神经发育相关表观遗传调控因子神经系统多梳蛋白1在基因组上的结合靶点.方法:扩增未分化状态的小鼠畸胎瘤P19细胞系(内源性高表达神经系统多梳蛋白1基因),使用兔源抗神经系统多梳蛋白1多克隆抗体进行P19细胞的染色质免疫沉淀实验,并结合采用高通量芯片检测技术(ChIP-on-chip)检测捕获靶基因序列,最后利用生物信息学在线软件分析神经系统多梳蛋白1结合靶点临近基因功能的分类特点.结果与结论:筛选出约1 280个神经系统多梳蛋白1结合靶点,靶点临近或所在基因的功能主要与分化、发育、转录及其调节、神经发生等密切相关.提示全基因组结合靶点分析可有效揭示神经系统多梳蛋白1基因在体外神经干细胞分化模型P19细胞中结合并可能参与调控的靶基因谱的分布特点,有利于下一步深入开展干细胞调控相关因子神经系统多梳蛋白1的下游信号通路研究.
关键词：神经系统多梳蛋白1染色质免疫沉淀全基因组结合靶点分析干细胞调控因子
分类号：R394.2(医学遗传学)
资助基金：国家自然科学基金(31070929)武警后勤学院博士启动基金(WYB201104)
论文发表日期：2012-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 4259-4262 )
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