人脂肪干细胞脂向分化中长非编码RNA的差异表达
岳文峻
王香梅
张芹
黄海华
韦有万
彭智
1.广东医学院附属医院,广东省湛江市,5240002.广东医学院附属医院,广东省湛江市,5240003.广东医学院附属医院,广东省湛江市,5240004.广东医学院附属医院,广东省湛江市,5240005.广东医学院附属医院,广东省湛江市,5240006.广东医学院附属医院,广东省湛江市,524000
摘要:背景:肥胖导致了包括高血压、冠心病、脂肪肝、高脂血症、2型糖尿病在内的诸多疾病,因此深入理解脂肪细胞分化机制对于肥胖的防治具有深远意义。目前对于脂向分化机制的研究多集中在微小RNA上,对于长非编码RNA在脂向分化过程中的作用尚且知之甚少。目的:获得脂向分化过程中差异倍数明显的长非编码RNA,并进一步筛选在脂向分化过程中可能发挥重要作用的长非编码RNA进行验证。方法:取人腹部皮下脂肪,采用组织块培养法获取脂肪干细胞,传至第3代后进行成脂诱导分化,通过微阵列技术对脂向分化过程中0,5,12 d长非编码RNA及mRNA差异性表达量进行统计,并结合生物信息学报告筛选出呈现明显差异性表达的长非编码RNA,通过qRT-PCR进行验证。结果与结论:脂向分化过程中以差异倍数1.5(P <0.05)为标准,上调长非编码RNA的数量5 d vs.0 d 748个,12 d vs.0 d 847个,12 d vs.5 d 593个;下调长非编码RNA的数量5 d vs.0 d 828个,12 d vs.0 d 1113个,12 d vs.5 d 750个;结合生物信息学分析结果,在与脂类代谢有关的28个长非编码RNA中根据诱导0,5,12 d 差异表达倍数较高且其靶基因可能是已知的与成脂相关的基因中,筛选出3个长非编码 RNA:AK304548、BP216319、DA852857。通过PCR验证结果显示AK304548、BP216319及其靶基因表达量呈现先下调后上调的趋势,与微阵列测序结果相符,预示其在脂向分化过程中起到调控作用。
关键词:干细胞脂肪干细胞脂向分化长链非编码RNA差异性表达lncRNAs生物信息学报告qRT-PCR
分类号:R394.2(医学遗传学)
资助基金:广东医学院建博科技创新团队培育型立项资助(TD1123)课题名称长链非编码RNA在人脂肪干细胞脂向分化过程中的差异性表达分析Funding(No. TD1123)
论文发表日期:2014-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 4491-4497 )
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中国组织工程研究

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北大核心CSTPCD
ISSN:2095-4344
年,卷(期):2014,(28)
所属栏目:研究与报告 -- 脐带脐血干细胞