骨关节炎基因差异谱的生物信息学分析
董政权1
魏垒2
1.山西医科大学第二医院骨科,山西省太原市,0300012.美国布朗大学医学院/罗德岛州医院骨科,美国罗德岛州 RI02903
摘要：背景:骨关节炎对中老年人群的健康具有重要的威胁,其疾病发生发展受到多个基因的调控,但其具体机制尚未明确.目的:应用生物信息学方法研究骨关节炎的差异基因表达.方法:从GEO在线数据库中下载并分析获得在骨关节炎发生时关节滑膜组织中明显表达差异的158个基因.通过DAVID数据库对基因进行功能富集.通过STRING数据库分析蛋白质与蛋白质间相互作用关系.结果与结论:共筛选出158个差异基因,其中上调12个,下调146个.利用DAVID数据库对差异基因进行GO和KEGG Pathway分析显示,差异基因主要富集在破骨细胞分化的正性调节、细胞连接等功能以及MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路及ECM受体相互作用等信号通路.将差异基因进行蛋白质相互作用分析后筛选出网络的核心基因为VEGFA,JUN,PRKACA,PXN,SPTAN1,核心基因之间存在复杂的相互作用.结果证实,差异基因的相互作用可能与骨关节炎的发生有关,可为骨关节炎的诊疗提供新的靶点.
关键词：骨关节炎生物信息学分析差异基因基因芯片生物功能组织工程破骨细胞分化细胞连接MAKP信号通路P13K-Akt信号通路蛋白质相互作用
分类号：R445(诊断学)
资助基金：国家自然科学基金(81572098)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 335-340 )
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