生物信息分析细粒棘球绦虫EgA31蛋白T细胞及B细胞的优势抗原表位
赵骁1
张峰波2
王红英1
闫芳3
安梦婷1
李玉娇1
庞楠楠4
丁剑冰1
1.新疆医科大学基础医学院,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市,8300112.新疆医科大学第一附属医院检验科,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市,8300543.新疆医科大学第一附属医院呼吸科,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市,8300544.新疆医科大学第一附属医院血液科,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市,830054
摘要：背景:EgA31蛋白是参与成虫吸盘肌收缩的一类蛋白,是细粒棘球蚴绦虫保护性免疫中重要的候选疫苗分子.目的:应用生物信息学方法对细粒棘球绦虫EgA31蛋白进行分析,预测其可能的T细胞及B细胞优势抗原表位.方法:从GenBank中获取EgA31蛋白的氨基酸序列(GenBank登记号为AAC21558.1),利用ProtParam在线程序分析EgA31蛋白的分子质量、理论等电点、氨基酸组成、原子组成、消光系数、不稳定系数和总平均疏水性,DNAstar Protein模块、SOPMA在线服务器分析蛋白二级结构,Phyre的同源建模服务器预测其蛋白质三级结构,最后通过ABCpred、BepiPred、SYFPEITHI、IDBE等软件联合预测细粒棘球绦虫EGA31蛋白的T细胞及B细胞的优势抗原表位.结果与结论:①EgA31蛋白由601个氨基酸组成,其中含有112个强碱性氨基酸,121个强酸性氨基酸,归类为不稳定且亲水性蛋白;②在线分析发现,EgA31蛋白的二级结构中α-螺旋约占82.36％,延长链约占4.16％,β-转角约占3.16％,无规则卷曲约占10.32％;③通过ABCpred、BepiPred、SYFPEITHI、IDBE等软件联合分析后预测了4段优势T细胞抗原、6段优势B细胞抗原以及1段T-B细胞联合表位;④生物学信息方法能较为全面地预测细粒棘球绦虫EgA31蛋白的优势T细胞及B细胞抗原表位,为进一步研制疫苗和检测试剂奠定了基础.
关键词：细粒棘球蚴包虫病EgA31生物信息技术T细胞表位B细胞表位蛋白质二级结构蛋白质三级结构疫苗优势抗原表位组织构建
分类号：R446(诊断学)R318(医用一般科学)
资助基金：国家自然科学基金(81460307)国家自然科学基金(31560262)新疆维吾尔自治区项目(XJDX0202-2010-04)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1078-1083 )
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