一例白血病患者及家系HLA-B基因全长序列及18个点突变分析
钟艳平
邹红岩
全湛柔
邓志辉
洪文旭
1.深圳市血液中心输血医学研究所,广东省深圳市,5180202.深圳市血液中心输血医学研究所,广东省深圳市,5180203.深圳市血液中心输血医学研究所,广东省深圳市,5180204.深圳市血液中心输血医学研究所,广东省深圳市,5180205.深圳市血液中心输血医学研究所,广东省深圳市,518020
摘要：背景:人类白细胞抗原HLA经过长期进化形成丰富的多态性,近几年由于受检人数增加及HLA分型技术快速发展,HLA新基因不断被发现.目的:采用下一代测序技术对1例白血病患者及家系HLA-B基因的全长序列及18个点突变进行分析.方法:应用序列特异性寡核苷酸探针杂交(PCR-SSOP)及聚合酶链反应-直接测序法(PCR-SBT)发现患者的HLA-B结果异常.为了鉴定该基因,采用下一代测序技术对该基因全长进行测序,同时采集患者父亲、母亲及2位同胞姐妹的血样进行HLA基因的遗传学分析.结果与结论:应用序列特异性寡核苷酸探针杂交及聚合酶链反应-直接测序法均提示该样本HLA-B无完全匹配的基因型.应用下一代测序技术分析发现,与同源性最高的等位基因B*15:09:01相比,该基因在外显子、内含子和3′UTR共存在18个碱基突变.5个外显子碱基突变位于第3,4外显子,分别为:第486位G→C、第583位T→C、第636位T→C、第652位A→G和第756位C→T,导致5个相应密码子发生改变,其中2个碱基替换为错义突变,第171位酪氨酸(Tyr)→组氨酸(His)、第194位异亮氨酸(Ile)→缬氨酸(Val).家系调查显示患者HLA-B新基因来源于父亲.新基因序列已递交给Genbank数据库(MG595995).应用下一代测序技术鉴定了1个HLA-B新等位基因,该基因于2017年12月被WHO HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*15:435.
关键词：白血病人类白细胞抗原新等位基因下一代测序技术家系调查碱基突变序列特异性寡核苷酸探针杂交聚合酶链反应-直接测序法
分类号：R459.5(治疗学)R394(医学遗传学)R552(血液及淋巴系疾病)
资助基金：深圳市医疗卫生三名工程项目(SZSM201811092)深圳市卫生计生系统科研项目(201506076)
论文发表日期：2020-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 77-82 )
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