牙周重建生物功能与调节通路关键基因的筛选
冯冬菲1
何洪旭2
谢琪2
张立立3
周惠2
李威2
1.哈尔滨市儿童医院,黑龙江省哈尔滨市150010;哈尔滨市口腔医院,黑龙江省哈尔滨市1500162.哈尔滨市儿童医院,黑龙江省哈尔滨市1500103.哈尔滨市口腔医院,黑龙江省哈尔滨市150016
摘要：背景:在牙周重建组织工程学中,包含基因众多且无法通过生物实验逐一验证.借助生物信息学手段,整合分析相关基因,构建牙周重建相关的级联调控通路,从而找到开启牙周重建的关键基因.目的:文章以分析牙周重建生物过程和调节机制为着眼点,旨在筛选出牙周重建过程中关键性的启动基因,为牙周重建治疗寻找理想的基因靶点.方法:①采用GO功能注释体系,对参与牙周重建的干细胞分化、骨组织改建以及牙周软组织形成功能的基因做整合分析,找出各功能交集基因;②集成TRANSFAC、TarBase、TransmiR、miRTarBase及miRecords数据库,建立"牙周重建相关的级联调控通路",将牙周重建生物学过程内的所有基因映射到调控网络内,用广度优先算法将这一子网内的所有线性通路挖掘出来,找出调控上游基因.结果 与结论:①干细胞分化、成骨细胞分化/成骨细胞增殖以及成纤维细胞增殖3种生物功能的交集基因是CDK6和SFRP1;②级联调控通路中,可以作为上游调控牙周重建的关键基因有3个一级基因:骨形态发生蛋白7、PAX2和SMAD3,有2个二级基因:RUNX2和JUN,有2个3级基因:ESR1和GNAS;上游起始基因多包含在成骨细胞分化/成骨细胞增殖功能过程中;③结果证实:SFRP1,骨形态发生蛋白7,PAX2,SMAD3,RUNX2,JUN,ESR1,GNAS基因在牙周重建过程中起关键作用.牙周重建过程极有可能开始于骨组织改建,包括成骨细胞分化和成骨细胞增殖,接下来是成纤维细胞增殖.
关键词：干细胞成骨细胞细胞增殖牙周重建生物信息学生物功能调节通路基因
分类号：R459.9(治疗学)R363(病理学)R364(病理学)
资助基金：哈尔滨市科技局项目(2016RAXYJ082)
论文发表日期：2022-01-11
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 253-259 )
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