酒精性股骨头坏死竞争性内源RNA网络及潜在生物标志物的综合分析
钱晓芬1
曾平2
刘金富2
陈财1
范思奇2
农焦2
邓伟2
1.广西中医药大学研究生院,广西壮族自治区南宁市 5302992.广西中医药大学第一附属医院,广西壮族自治区南宁市 530023
摘要:背景:酒精性股骨头坏死与饮酒具有高度的相关性,然而其具体发病机制尚不明确且存在一定的个体差异.目的:构建酒精性股骨头坏死的基因网络图谱,进一步探索酒精性股骨头坏死的潜在发病机制.方法:从广西中医药大学第一附属医院骨二科招募3例酒精性股骨头坏死患者和3名健康志愿者,通过对其外周血进行基因测序筛选具有差异表达的mRNA和lncRNA,通过预测lncRNA-miRNA和miRNA-mRNA的相互作用靶点,使用cytoscape软件构建竞争性内源RNA调控网络.结果 与结论:①通过差异表达分析从酒精性股骨头坏死样本中鉴定出了差异lncRNA 127个、差异mRNA 921个,通过靶基因预测共预测出了205个miRNA及5184个mRNA靶点,最终构建了包含3个lncRNA(SNHG3、MUC19、LINC00476)、5个miRNA(hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-139-5p、hsa-miR-126-3p、hsa-miR-193a-3p、hsa-miR-135a-5p)和11个mRNA(PEX5、ACTR3B、CHMP4B、CSMD1、MTRF1、ZNF3、HTR7、NR5A2、SYT14、CASK、ING5)的ceRNA网络,涉及干细胞分化、炎症反应、神经内分泌、基因多态性等多种生物学过程.②结果表明,通过构建竞争性内源网络筛选出了一系列酒精性股骨头坏死潜在的生物标志物,为进一步研究其分子机制及治疗靶点提供了新思路.
关键词:酒精性股骨头坏死竞争性内源RNA(ceRNA)网络lncRNAmRNAmiRNA生物标志物
分类号:R459.9(治疗学)R365(病理学)R681.8(骨科学(运动系疾病、矫形外科学))
资助基金:国家自然科学基金(81960876,82160913)大数据库时代广西股骨头坏死临床数据库的建设(2018XK073)广西壮族自治区中医药局中医药适宜技术开发与推广项目(GZSY21-14)广西壮族自治区中医药局自筹经费科研课题(GXZYZ20210443)
论文发表日期:2022-08-11
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 3670-3675 )
英文信息
