全外显子测序盘状半月板的病因学分析
张键
林坚平
周钢
王本超
吴永昌
海南医学院附属海南医院(海南省人民医院)关节外科,海南省海口市 570311
摘要:背景:盘状半月板是一种半月板形态学改变,至今发病机制不明,目前尚无关于盘状半月板的基因组学研究.目的:通过外显子测序结合生物信息学分析筛选盘状半月板可疑致病基因.方法:提取7例盘状半月板患者的外周血DNA,分别建库后进行全外显子测序,测序数据与公共基因组数据库对比筛选变异位点,并进行可疑致病突变注释及解读.结果 与结论:①7例患者共筛选出变异位点6943个,其中错义突变3620个,同义突变732个,剪接位点附近的突变488个,剪接位点突变45个,外显子重复20个,外显子缺失84个,非移码突变136个,截断突变54个,延长突变5个,起始位点突变8个;②基于共有突变基因和公共基因数据库筛选出可疑致病基因6个,分别为PADI4、FLNB、SYNE1、COL11A2、COL2A1、MYO9A,包含变异位点15个,结合突变频率数据库、蛋白危害性分析结果和国内外相关研究确定盘状半月板可疑基因为PADI4、FLNB、SYNE1、COL11A2、COL2A1.
关键词:盘状半月板全外显子测序病因学发病机制基因组学
分类号:R459.9(治疗学)R318(医用一般科学)R604(外科诊断学)
资助基金:海南省重点研发任务计划(ZDYF2017112)海南医学院研究生创新创业项目(HYYS2020-36)
论文发表日期:2023-01-11
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 192-199 )
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