骨关节炎坏死性凋亡关键基因的筛选与验证
袁长深1
官岩兵2
李哲2
容伟明2
廖书宁2
陈乐伟2
梅其杰1
段戡1
1.广西中医药大学第一附属医院骨三科,广西壮族自治区南宁市 5300232.广西中医药大学研究生院,广西壮族自治区南宁市 530000
摘要：背景:骨关节炎与慢性、低度炎症密切相关.坏死性凋亡是一种具有广泛炎症特性的新型细胞死亡途径,可影响骨关节炎进展,但目前尚未发现骨关节炎坏死性凋亡的相关靶点.目的:基于生物信息学挖掘骨关节炎坏死性凋亡关键基因,并利用动物实验加以验证,为从坏死性凋亡角度防治骨关节炎提供新的靶点.方法:分别从GEO数据库与GeneCards数据库筛选出骨关节炎相关基因和坏死性凋亡相关基因,继而对两者取交集获得骨关节炎坏死性凋亡基因,进一步进行GO及KEGG富集分析,构建PPI网络,通过Cytoscape软件的5种计算方法获得骨关节炎坏死性凋亡关键基因(Hub基因),最后选用雄性SD大鼠建立膝关节骨关节炎中期模型,通过RT-PCR检测Hub基因在SD大鼠骨关节炎中期模型中的表达情况.结果 与结论:①共筛选出38个骨关节炎坏死性凋亡基因,GO及KEGG分析发现其主要在白细胞活性、T细胞受体及白细胞介素17信号通路等方面显著富集;通过Cytoscape的5种不同算法筛选出CYBB、FADD、IL1B、MYC及EGFR 5个Hub基因;②RT-PCR检测结果显示,与正常对照组比较,雄性SD大鼠骨关节炎中期模型软骨中EGFR、IL1B基因呈高表达(P<0.05),CYBB、MYC基因呈低表达(P<0.05),FADD基因表达无明显变化(P>0.05);③结果 显示,CYBB、IL1B、MYC及EGFR可作为骨关节炎坏死性凋亡的关键基因,有望成为防治骨关节炎的新靶点.
关键词：骨关节炎坏死性凋亡关键基因生物信息学实验验证
分类号：R459.9(治疗学)R319(医用一般科学)R684.3(骨科学（运动系疾病、矫形外科学）)
资助基金：国家自然科学基金(82060875)国家自然科学基金(82160912)广西中医药大学自然科学研究项目(2019QN022)中医学广西一流学科(桂教科研号项目(2018]12;2019XK030)
论文发表日期：2023-02-11
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 695-700 )
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