骨髓炎状态下成骨诱导大鼠骨髓间充质干细胞转录组的测序分析
文虹杰1
陈仲1
杨华刚1
徐永清2
1.云南大学附属医院骨科,云南省第二人民医院骨科,云南省昆明市 6500212.中国人民解放军联勤保障部队第920医院骨科,云南省昆明市 650021
摘要：背景:近来发现骨髓炎环境会显著抑制骨髓间充质干细胞的成骨分化能力,进而对骨形成和骨代谢造成影响,但其具体的作用机制尚不十分清楚.目的:通过对葡萄球菌A蛋白作用下诱导成骨分化的大鼠骨髓间充质干细胞进行转录组分析,寻找潜在差异表达长链非编码RNA(lncRNA)及相关调控网络.方法:将大鼠骨髓间充质干细胞分为实验组和对照组,前者在葡萄球菌A蛋白(1μg/mL)模拟的骨髓炎环境下成骨诱导分化7,14 d,后者正常成骨诱导分化7,14 d;通过茜素红染色以及碱性磷酸酶活性检测观察两组细胞成骨诱导分化情况;收集两组细胞进行转录组测序,进行GO、KEGG生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR进一步验证差异表达lncRNA.结果 与结论:①成骨诱导分化7,14 d,对照组茜素红着色面积均高于实验组,对照组碱性磷酸酶活性明显高于实验组(P<0.01);②转录组测序结果显示328个lncRNAs表达差异,其中显著上调的184个,显著下调的144个;③基因本体富集分析发现差异表达基因功能主要涉及生物过程、细胞组分以及分子功能,KEGG富集分析发现主要参与的信号转导途径有肿瘤坏死因子信号通路、MAPK信号通路、肠道炎症疾病通路等,与骨形成、骨代谢相关;④选取与成骨分化相关的差异表达明显的6个lncRNAs,qPCR验证后发现ENSRNOT00000092811、TCONS_00023877、XR_001836916.1与高通量测序中的表达趋势一致;⑤结果表明,多个lncRNA参与骨髓炎状态的大鼠骨髓间充质干细胞成骨分化能力调节,且可能通过信号转导途径肿瘤坏死因子信号通路、MAPK信号通路等发挥作用.
关键词：骨髓炎骨髓间充质干细胞成骨分化转录组测序lncRNA
分类号：R459.9(治疗学)R318(医用一般科学)R681.2(骨科学（运动系疾病、矫形外科学）)
资助基金：云南省基础研究计划昆医联合专项-面上项目(202201AY070001-274)云南省教育厅科学研究基金项目(2022J0016)国家自然科学基金(82072392)
论文发表日期：2023-05-21
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 2333-2338 )
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