神经源性膀胱miRNA-mRNA调控网络的筛选与验证
郭淑慧1
杨晔1
江杨洋2
许建文1
1.广西医科大学第一附属医院,广西壮族自治区南宁市 5300002.广西医科大学第四附属医院,广西壮族自治区柳州市 545000
摘要：背景:miRNA-mRNA调控网络在各种生物过程中发挥重要作用,但其在脊髓损伤后神经源性膀胱中的具体作用机制尚不清楚.目的:基于生物信息学挖掘神经源性膀胱的相关靶点,并构建miRNA-mRNA调控网络,加以动物实验验证.方法:从GEO数据库筛选神经源性膀胱的差异基因,构建miRNA-mRNA调控网络.利用David数据库对差异基因进行GO和KEGG分析,利用STRING数据库进行PPI分析,并通过Cytoscape和ROC曲线筛选关键基因,最终通过神经源性膀胱大鼠模型对关键基因进行RT-PCR验证.结果 与结论:①共筛选出188个神经源性膀胱的差异基因,GO及KEGG分析发现其主要在炎症反应、Cytokine-cytokine受体相互作用、趋化因子信号通路等方面显著富集;通过Cytoscape及ROC曲线结果筛选出miR-147-脑源性神经营养因子和miR-362-5p-Scn9a 2个关键调控网络;②RT-PCR检测结果显示,与对照组比较,神经源性膀胱模型大鼠中miR-147、miR-362-5p、脑源性神经营养因子表达量上调,Scn9a基因下调;③结果 提示,miR-147-脑源性神经营养因子、miR-362-5p-Scn9a作为炎症、氧化应激等病理生理过程的重要调控因子,有望成为诊断和治疗神经源性膀胱的新靶点.
关键词：神经源性膀胱脊髓损伤生物信息学GEO数据库差异基因调控网络miRNA-mRNA炎症氧化应激
分类号：R459.9(治疗学)R363(病理学)R-332(实验医学、医学实验)
资助基金：国家自然科学基金(81960417)广西自然科学基金项目(2018GXNSFAA050033)
论文发表日期：2023-07-11
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 3143-3150 )
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