铜死亡调节因子在骨关节炎诊断及亚分型中的作用
熊波1
王斌2
刘金富1
陆冠宇1
陈财1
黄悦1
陈莉华1
1.广西中医药大学研究生院,广西壮族自治区南宁市 5302992.广西中医药大学第一附属医院,广西壮族自治区南宁市 530023
摘要:背景:滑膜在骨关节炎的病程发展过程中发挥着重要作用,而铜死亡是近期最新发现的一种新型细胞程序性死亡,目前尚未有从滑膜角度探究铜死亡基因在骨关节炎中的相关机制研究.目的:以滑膜为切入点从铜死亡角度探究影响骨关节炎发生发展的潜在机制.方法:通过GEO数据库检索符合条件的骨关节炎相关芯片,对其进行标准化处理,基于处理后的基因表达矩阵进行铜死亡相关基因提取和量化,通过随机森林树模型、支持向量机模型、机器学习、列线图模型构建疾病预测模型以预测骨关节炎患病的风险.然后,运用共识聚类算法、主成分分析(PCA)、单样本基因组富集分析(ssGSEA)及免疫浸润分析铜死亡分子亚型与免疫微环境及炎症因子的相关性.结果与结论:①首次建立了基于铜死亡特征基因的风险预测模型,由3个铜死亡特征基因(DBT、LIPT1、FDX1)构建的疾病预测模型可以较好预测骨关节炎患病的风险;②首次发现骨关节炎患者可分型为两种完全不同的铜死亡分子亚型(族A和族B),族B与Th1/Th2 细胞比例失衡高度相关,具有更高的白细胞介素2、白细胞介素4、白细胞介素5表达水平.
关键词:膝骨关节炎铜死亡预测模型机器学习免疫浸润炎症因子分子亚型
分类号:R446(诊断学)R318(医用一般科学)R496(康复医学)
资助基金:广西中医药大学校级项目(YCXJ2021070)广西高校中青年教师科研基础能力提升项目(2022KY0282)
论文发表日期:2023-12-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 5530-5537 )
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