DOI: 10.12307/2024.352
软骨细胞中SIRT1基因敲减后作用状态不明确信号通路及对相关疾病或功能的影响
叶海明1
曾晖1
杨琪2
张耕1
翁鉴1
于斐1
1.北京大学深圳医院,骨关节科,广东省深圳市 518036;骨科生物材料国家地方联合工程研究中心,广东省深圳市 518036;深圳市骨科疾病与生物材料研究重点实验室,广东省深圳市 5180362.北京大学深圳医院,超声影像科,广东省深圳市 518036
摘要：背景:沉默信息调节因子1以去乙酰化的方式调控软骨细胞中相关蛋白的功能,参与软骨细胞增殖分化,促进软骨缺损修复.
目的:利用高通量技术筛选软骨细胞中沉默信息调节因子1基因敲减后作用状态不明确的信号通路以及产生变化的疾病或功能.
方法:取处于对数生长期的小鼠ATDC5软骨细胞,分2组转染:对照组转染沉默信息调节因子1基因敲减阴性对照慢病毒,实验组转染沉默信息调节因子1基因敲减慢病毒.转染72 h后,利用小鼠基因表达谱芯片GeneChip® Mouse Genome 430 2.0 Array检测mRNA的基因层面变化情况,应用生物信息学技术筛选激活或抑制不明确的信号通路以及这些信号通路相关因子,并分析疾病或功能模块的富集情况.
结果与结论:①沉默信息调节因子1基因敲减后,小鼠ATDC5软骨细胞中激活或抑制状态不明确的信号通路有245条;②根据-log(P-value)排序选择排前20的激活或抑制状态不明确信号通路中的因子情况进行报道,包括IGFBP4、TGFBR1、CTGF、COL4A5、LHX2、IL1RL1、KLF6等;③根据-log(P-value)进行排序,细胞生长和增殖、生物体存活和细胞死亡与存活等14个疾病和功能密切相关模块明显变化;根据差异基因数量排序,生物体损伤和异常、癌症和细胞死亡与存活 3个疾病和功能密切相关模块明显变化;根据-log(P-value)与差异基因数量综合排序,固有免疫应答这一疾病和功能模块被显著激活.
关键词：高通量测序沉默信息调节因子1软骨缺损信号通路疾病或功能
分类号：R459.9(治疗学)R319(医用一般科学)R684.3(骨科学（运动系疾病、矫形外科学）)
论文发表日期：2024-07-11
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 3123-3129 )
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