DOI: 10.12307/2025.957
缺血性脑卒中诊断性生物标志物解析及靶向铜死亡相关基因的实验验证
陈莹1
郭晓婧2
莫雪妮2
马威2
武尚志2
李相玲2
谢婷婷2
1.广西中医药大学中医药壮瑶医药研究院,广西壮族自治区南宁市 530022;广西国际壮医医院康复科,广西壮族自治区南宁市 5300222.广西中医药大学中医药壮瑶医药研究院,广西壮族自治区南宁市 530022
摘要：背景:研究表明,缺血性脑卒中的各个过程都有免疫细胞参与,其中铜死亡也起着关键作用.
目的:通过生物信息学筛选出与缺血性脑卒中进展有关的诊断性生物标记物,并对与其发生发展密切相关的铜死亡基因进行分析及验证.
方法:从GEO数据库中获取GSE16561芯片,共包含39例缺血性脑卒中组与24例对照组数据,解析缺血性脑卒中芯片数据的差异表达基因,对差异基因进行GO与KEGG富集分析;通过LASSO和Random Forest法,筛选出影响缺血性脑卒中发生发展的关键基因,建立诊断模型并加以验证;通过免疫细胞浸润与加权基因共表达网络对差异基因进行分析,差异表达的免疫相关基因与铜死亡基因取交集,获得铜死亡免疫相关的Hub基因,并进行体外细胞实验,将大鼠海马神经元细胞分为正常组和缺血性脑卒中组,进行qPCR实验验证.
结果与结论:①差异分析获得573个差异表达基因,主要富集于免疫反应的正向调节等生物学过程和脂质与动脉粥样硬化等信号通路;②机器学习方法筛选出MFN2、PKM2、CREG1、FOXO3A诊断性基因,对缺血性脑卒中可能具有一定的诊断价值;③免疫浸润分析发现浆细胞、NK细胞静息、巨噬细胞等,表明免疫细胞在缺血性脑卒中的发病中发挥着一定作用;④WGCNA结合免疫浸润分析获得118个关键模块基因,与铜死亡基因取交集获得2个铜死亡与免疫特征基因;4个诊断性基因与Hub基因的相关性分析结果显示FOXO3A与MFN2、PKM2与BCL2L1、MTF1与MFN2、ATP7B与BCL2L1的表达具有相关性;⑤qPCR结果显示,与空白组相比,缺血性脑卒中组基因MTF1、ATP7B存在显著差异,证实ATP7B、MTF1可作为缺血性脑卒中铜死亡的特征基因,可能通过干预ATP7B、MTF1调节铜死亡来改善缺血性脑卒中.
关键词：缺血性脑卒中机器学习生物信息学免疫浸润铜死亡细胞实验ATP7BMTF1
分类号：R496(康复医学)R318(医用一般科学)R743.3(神经病学与精神病学)
论文发表日期：2025-12-18
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 7562-7570 )
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