DOI: 10.12307/2026.040
自噬相关基因在肺纤维化模型中的表达:生物信息学分析及实验验证
刘可新1
郝凯敏2
庄文越3
李正祎4
1.吉林医药学院,吉林省吉林市 132001;北华大学,吉林省吉林市 1320012.北华大学,吉林省吉林市 1320013.北华大学,吉林省吉林市 132001;浙江万里学院,浙江省宁波市 3151004.吉林医药学院,吉林省吉林市 132001
摘要：背景:自噬对上皮细胞、成纤维细胞和肌成纤维细胞之间的应激作用与肺纤维化的形成过程密切相关.
目的:筛选肺纤维化患者基因水平变化与自噬相关的基因,并探究其与肺纤维化患者预后的关联,以期为临床干预肺纤维化提供新的靶点.
方法:以GSE70866下载的基因表达谱数据集为训练集,利用R语言对肺纤维化患者和正常健康者之间基因表达进行差异分析并与自噬相关基因取交集,鉴定出变化最为显著的差异基因.运用多种分析方法筛选出关键预后基因,并构建基因预后模型.根据肺纤维化患者的风险评分分为高风险组和低风险组,应用Siena cohort和Leuven cohort验证集验证预后模型的有效性.并通过转化生长因子β1诱导HFL-1细胞(人胚肺成纤维细胞)建立肺纤维化细胞模型以及博莱霉素气管滴注建立小鼠肺纤维化动物模型验证预后基因的表达.
结果与结论:①肺纤维化组织和正常组织之间存在2 650个差异基因,其中与自噬相关基因有34个发生显著变化;②Siena cohort和Leuven cohort验证集的Kaplan-Meier生存分析曲线显示,高风险组的存活率明显比低风险组低;③筛选出3个与预后相关的自噬基因:骨髓瘤病病毒癌基因、趋化因子配体2、GABAA型受体相关蛋白样1;④体内外研究均显示与对照组相比,肺纤维化模型组骨髓瘤病病毒癌基因和趋化因子配体2mRNA及蛋白表达显著升高(P＜0.01,P＜0.05),而GABAA型受体相关蛋白样1 mRNA及蛋白表达有所降低(P＜0.001);⑤结论:通过生物信息学方法分析了3个自噬相关基因在肺纤维化中的表达及其与肺纤维化患者预后的相关性,构建的预后模型对肺纤维化患者1,2,3年生存率具有良好的预测能力;并且通过体内和体外模型验证了在肺纤维化细胞和组织中骨髓瘤病病毒癌基因和趋化因子配体2呈高水平表达,GABAA型受体相关蛋白样1呈低水平表达.
关键词：肺纤维化自噬生物信息学差异表达基因预后模型R语言博莱霉素TGF-β1
分类号：R446(诊断学)R318(医用一般科学)R563(呼吸系及胸部疾病)
论文发表日期：2026-02-18
在线出版日期：2025-12-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 1129-1138 )
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