樱草杜鹃等10种藏药材的COXⅢ基因部分片段的扩增与序列分析
郝豆豆1
张勇群2
雷鸣3
拉多3
1.西藏大学,西藏 拉萨 850000;西藏自治区人民政府驻成都办事处医院,四川 成都 6100002.西藏自治区人民政府驻成都办事处医院,四川 成都,6100003.西藏大学,西藏 拉萨,850000
摘要：文章以樱草杜鹃、大花黄牡丹、长鞭红景天、露蕊乌头、苞叶雪莲、藏橐吾、独一味、砂生槐、拉萨蒲公英、拉萨小檗10种藏药材为研究对象,提取基因组DNA,对其线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅲ亚基(cox3)的部分片段进行了PCR扩增、测序及序列分析,用Bioedit软件与GenBank数据库中相关植物的序列进行序列比对,并用MEGA6.0软件做系统进化树(NJ),运用CodonW软件计算密码子的RSCU值.通过PCR扩增获得了10种藏药材的长度为750bp的目的片段,通过序列比对发现cox3基因在不同植物中变异位点较少,序列比较保守;基于cox3部分基因序列构建的NJ树反映了物种的进化关系,可以作为物种系统发育分析的补充;密码子偏好性分析发现,cox3基因偏好使用以AU结尾的密码子.樱草杜鹃等10种藏药材的COXⅢ基因部分片段的扩增与序列分析从序列比对分析、构建系统进化树、密码子偏好性分析水平上分析了cox3基因部分序列在樱草杜鹃等10种藏药材的差异,为植物cox3基因的功能、表达研究奠定了基础.
关键词：藏药材cox3基因序列分析
资助基金：西藏大学研究生高水平人才培养科研基金项目(2015-GSP-024)湖南师范大学蛋白质与发育生物学教育部重点实验室开放课题(2014;2015DF03)国家自然科学基金(2015ZR-13-5)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 56-61 )