拉萨野生棕色蘑菇的全基因组测序
郭晓飞1
汪艳1
德吉1
牟涛1
李俊1
秦强1
杨满军2
1.拉萨市高原生物研究所2.西藏职业技术学院,西藏拉萨850030
摘要：本研究采用Illumina Hiseq二代测序和GridION Nanopore纳米孔三代测序结合对拉萨市野生棕色蘑菇进行基因组测序获得4083207300bp的原始数据,数据经过处理后,拼接获得18条完整的染色体,开放阅读框和基因数为3798个,合计30069126bp,最小的染色体长度为46397bp,最大的3600717bp,全基因组的GC含量为46.53％,每条染色体平均长度为1.67Mbp.利用KOG对3798个基因进行功能注释,主要分为24类功能.同时使用MISA程序对参考基因组序列中的微卫星重复位点进行分析,得到3134个微卫星标记位点.
关键词：拉萨棕色蘑菇全基因组测序
资助基金：西藏自治区重点研发及转化计划项目(XZ201801NB23)
论文发表日期：2019-12-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 17-21 )