基于网络药理学和分子对接的藏药"甘松-余甘子"治疗幽门螺杆菌相关胃炎的机制探究
杨帅1
王月2
李根3
张亮亮3
李楠4
张会存5
伊比然恨2
汪红兵6
1.首都医科大学附属北京中医医院消化科,北京 1000102.拉萨市人民医院,西藏 拉萨 8500003.北京中医药大学研究生院4.拉萨市人民医院,西藏 拉萨 850000;首都医科大学附属北京中医医院5.北京中医研究所,北京 1000106.首都医科大学附属北京中医医院消化科,北京 100010;拉萨市人民医院,西藏 拉萨 850000;首都医科大学附属北京中医医院
摘要：目的 文章基于网络药理学和分子对接的方法,探究藏药"甘松-余甘子"治疗幽门螺杆菌相关胃炎的相关作用机制.方法 运用TCMSP,获得藏药"甘松-余甘子"活性成分及相关的作用靶点,应用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获得幽门螺杆菌相关胃炎相关靶点,绘制韦恩图获取药物疾病共同靶点,将其输入Cytoscape 3.7.2软件绘制"药物-成分-疾病-靶点"网络.运用R语言及Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白相互作用PPI网络.通过R语言对靶点基因进行GO、KEGG集分析.分别采用AutoDock软件、Pymol软件进行分子对接、可视化验证.结果 藏药"甘松-余甘子"通过15个有效成分作用于16个幽门螺杆菌相关胃炎治疗靶点.筛选出4种核心有效成分,4个核心靶点包括PTGS2、TNF、CASP3、TP53.GO富集分析主要涉及神经元死亡调节、神经元死亡、电离辐射响应、糖皮质激素反应、对紫外线的反应、内在的凋亡信号通路、皮质类固醇反应等生物过程进行调节,KEGG富集分析主要涉及P53信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路.4种核心有效成分与主要核心靶点PTGS2、TNF、CASP3、TP53均具有一定的结合活性.结论 藏药"甘松-余甘子"治疗幽门螺杆菌相关胃炎的机制,可能是通过"多成分-多靶点-多通路",发挥抗炎、抗癌、抗氧化、抗凋亡、促进血管生成的作用.
关键词：甘松余甘子幽门螺杆菌相关胃炎网络药理学作用机制分子对接
资助基金：国家自然科学基金(mir-21;8177150984)
论文发表日期：2022-11-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 74-80 )