可变剪切事件在胰腺癌中的发生及其临床意义
帕成周
张贯启
邬善敏
1.430060 武汉大学人民医院肝胆外科2.430060 武汉大学人民医院肝胆外科3.430060 武汉大学人民医院肝胆外科
摘要：目的 探索胰腺癌(PAAD)中存在的差异RNA剪接模式,分析可变剪切(AS)事件与胰腺癌临床预后的关系.方法 自癌症基因组图谱(TCGA)中下载RNA-seq数据、临床数据资料,提取剪接因子(SF)表达量;采用TCGA SpliceSeq工具下载提取AS事件数据,评估7种可变剪切类型在胰腺癌病例中的发生情况;采用Kaplan-Meier分析及Cox回归分析评估AS事件风险值和生存时间之间的相关性,并探索PAAD的独立危险因素;采用Cytoscape构建基于生存相关的AS事件与SF的调控关系网络.结果 PAAD中与生存相关的AS事件以外显子跳跃(ES)类型多见,外显子互斥(ME)类型较少;各亚型AS事件对生存影响不同,低风险组的预后较好,且风险值可作为PAAD独立预后因素(P<0.01,AUC=0.765).剪接网络提示PAAD患者中剪接因子的表达与AS事件之间具有相关性.结论 AS事件风险值可作为PAAD的独立预后因子,且SF对AS事件的调控呈多样性,SF可能会作为PAAD治疗的潜在靶点.
关键词：胰腺癌可变剪切癌症基因组图谱剪接因子预后
资助基金：武汉市科技计划项目(201161038342-02)
论文发表日期：2020-02-18
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 155-159 )
英文信息