基于GO分析的全基因组芯片筛选小鼠牙囊发育早期差异表达基因的研究
张春光1
聂敏媛2
孟庆岩2
王洪云3
安钰4
董蕊5
党平2
1.解放军第323医院,陕西 西安,7100542.解放军第306医院,北京,1001013.天津海滨人民医院口腔科,天津,3002804.北大国际医院,北京,1022065.首都医科大学口腔医学院,北京,100050
摘要:目的:利用基于GO 分析的全基因组芯片技术筛选小鼠牙囊组织在个体发育不同时期的差异表达基因.方法:以激光显微切割技术获取胚胎17 d(E17)和出生后2 d(PN2)两个时期小鼠下颌第一磨牙的牙囊组织后,以改良Trizol法提取总RNA并制备荧光标记的cRNA;然后再以Aglient 小鼠全基因组表达芯片对比分析上述两时期的基因表达差异;最后以GeneSpringGX 7.3软件对所得结果进行归一化及倍数筛选,并分别以BioCarta、GenMAPP软件进行基因分类和GO分析.结果:①得到两个发育时期牙囊组织相对于牙乳头组织表达倍数都在10倍以上的一组基因;②得到细胞外基质等10余项常见生物功能相关的基因列表.结论:将激光显微切割以及基因表达芯片两种技术联合可用于小鼠牙周组织发育过程中差异表达基因.
关键词:激光显微切割技术牙胚发育基因芯片差异表达基因
分类号:R780.2(口腔病理学)
资助基金:首都卫生发展科研专项(2014-4-5051;13QN04)
论文发表日期:2017-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 123-128,163 )
英文信息展开
牙体牙髓牙周病学杂志

牙体牙髓牙周病学杂志

北大核心CSTPCD
ISSN:1005-2593
年,卷(期):2017,27(3)
所属栏目:基础研究