伴放线放线杆菌细胞致死性扩张毒素序列进化分析
孙静华1
张琛1
喻钢2
侯本祥1
1.首都医科大学附属北京口腔医院牙体牙髓科,北京,1000502.中国食品药品检定研究院,北京,100050
摘要：目的:应用生物信息学的方法研究伴放线放线杆菌(4a)细胞致死性扩张毒素(CDT)的3个蛋白亚基在不同细菌中的序列变化情况,为牙周病中Aa菌株的检测提供思路.方法:运用ncbigenbank数据库、蛋白同源性比对(blastP和tblastn)及极大似然法构建进化树等,研究Aa中CDT蛋白的3个亚基在不同菌种的序列保守性.结果:在Genbank数据库674个属的细菌中,发现有20个属27个种含有CDT蛋白亚基,其中11个种的细菌只含有CdtB蛋白亚基.在进化过程中,CdtB与CDT其他两种亚基蛋白相比,序列间的变化无明显相关性,且蛋白序列更为保守.系统进化树分析表明,Aa的CdtB蛋白与嗜血杆菌属、沙门氏菌属和螺杆菌属的细菌有较近的亲缘关系.结论:Aa CDT蛋白复合体的CdtB与其他两个亚基的蛋白在序列进化上存在显著差异,推测一些菌种中CDT蛋白毒性功能的发挥并不需要3个亚基共同存在.
关键词：伴放线放线杆菌细胞致死性扩张毒素进化生物信息学
分类号：R780.2(口腔病理学)
资助基金：国家自然科学基金(81400515)北京市医院管理局青年人才培养青苗计划(QML20161502)北京市自然科学基金(7142068)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 493-498,535 )
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