Luminal型与Basal-like型乳腺癌差异miRNAs的表达与预后分析
赵明娟1
刘江波2
袁芊芊3
邓通1
黄桥1
吴高松3
方程1
1.武汉大学中南医院循证与转化医学中心 武汉 4300712.河南科技大学第一附属医院甲状腺乳腺肿瘤外科 河南洛阳 4710003.武汉大学中南医院甲状腺乳腺外科 武汉 430071
摘要：目的 分析Luminal型和Basal-like型乳腺癌之间差异表达的microRNAs(miRNAs),探讨其表达水平与Luminal型和Basal-like型乳腺癌预后的关系.方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载包含Luminal和Basal-like乳腺癌患者相关的miRNAs微阵列数据集GSE81000与GSE40267,利用GEO2R在线分析工具筛选Luminal和Basal-like乳腺癌之间差异表达的miRNAs.通过mirDIP数据库预测其靶基因,并采用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)在人乳腺癌细胞MCF-7和MDA-MB-468中验证miRNAs的差异表达.利用METABRIC数据库,采用Kaplan-Meier Plotter在线工具分析miR-199a-5p和miR-199b-5p表达水平与Luminal型和Basal-like型乳腺癌预后的关系.结果 筛选出了35种在Luminal型和Basal-like型乳腺癌中差异表达的miRNAs.相较于Luminal型,18种miRNAs在Basal-like型中表达下调,17种表达上调.靶基因预测结果显示,35种差异表达miRNAs的潜在靶基因共4180个,其中最相关的靶基因有19个,对应的差异miRNAs为miR-199a-5p、miR-199b-5p.相较于Luminal型乳腺癌,miR-199a-5p和miR-199b-5p在Basal-like型乳腺癌中表达下调.qRT-PCR检测结果表明,miR-199a-5p和miR-199b-5p在MCF-7(Luminal型)和MDA-MB-468(Basal-like型)细胞中的表达水平与GEO2R分析结果趋势一致.生存分析结果表明,miR-199a-5p与miR-199b-5p低表达与Luminal A型乳腺癌患者的总生存率降低显著相关.结论 共筛选出35个在Luminal型和Basal-like型乳腺癌中差异表达的miRNAs.其中,miR-199a-5p、miR-199b-5p与乳腺癌的预后相关,有望成为治疗的新靶点.
关键词：miRNAsLuminal型乳腺癌Basal-like型乳腺癌生存分析
资助基金：中央高校基本科研业务费专项(2042019kf0173)
论文发表日期：2021-06-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 178-185 )
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