MTHFD2与头颈部鳞状细胞癌的肿瘤微环境相关性
史振祥1
吴洒2
蔡伟松1
明小平1
陈雄1
1.武汉大学中南医院耳鼻咽喉头颈外科(武汉 430071)2.华中科技大学同济医学院附属湖北妇幼保健院妇科Ⅱ(武汉 430070)
摘要:目的 采用生物信息学分析技术探讨亚甲基四氢叶酸脱氢酶 2(methylenetetrahydrofolate dehydrogenase 2,MTHFD2)在头颈部鳞状细胞癌(head and neck squamous cell carcinoma,HNSCC)中的表达、生物学功能、相关信号通路、肿瘤突变负荷、免疫细胞浸润及其与患者预后的关系.方法 在癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库中比较人HNSCC组织和正常组织中MTHFD2基因mRNA的相对表达水平,根据HNSCC患者癌组织中MTHFD2基因表达中位数分为高、低表达组,绘制Cox比例风险模型,Log-rank检验比较MTHFD2 高低表达组患者总生存期(OS)有无差异;对MTHFD2及相关基因功能进行KEGG和GO信号通路功能富集;使用R语言与maftools软件包分析MTHFD2与肿瘤突变负荷的相关性;使用TIMER 2.0相关模块分析癌组织肿瘤浸润情况.结果 MTHFD2基因mRNA在癌组织表达水平高于癌旁正常组织(P<0.05),随着MTHFD2基因mRNA表达水平的增高,HNSCC的分期增加(P<0.05),OS缩短(P<0.05);GSEA发现MTHFD2与细胞周期控制过程密切相关;MTHFD2的体细胞突变率为0.59%,且与肿瘤突变负荷显著相关(P<0.001);MTHFD2高表达时,NK CD56 bright细胞、T辅助细胞和Th2细胞显著上升.结论 MTHFD2可能作为HNSCC的预后性生物标志物,并可能在肿瘤浸润免疫细胞中发挥关键作用.
关键词:MTHFD2头颈部鳞状细胞癌预后肿瘤突变负荷
资助基金:中南医院科技创新培育基金面上培育项目(CXPY2020046)
论文发表日期:2024-06-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:10( 291-300 )
英文信息
