TRIM31与慢性肝病的孟德尔随机化及生物信息学分析
尤君怡1
梁国强2
宋秀道3
1.南京中医药大学附属苏州市中医医院中医外科(江苏 苏州 215009)2.南京中医药大学附属苏州市中医医院中心实验室(江苏 苏州 215009)3.南京中医药大学附属苏州市中医医院中医药科技转化中心(江苏 苏州 215009)
摘要：目的 使用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization,MR)分析评估肝脏TRIM31 表达水平与慢性肝病的因果关系,以及生物信息学方法分析TRIM31 在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的作用.方法 利用FinnGen R10 数据库中非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)、非酒精性脂肪性肝炎(non-alcoholic steatohepatitis,NASH)、肝纤维化、肝硬化、HCC的遗传数据,以及GTEx Portal肝组织cis-eQTL数据中与TRIM31 表达显著相关的单核苷酸多态性作为工具变量,采用逆方差加权法作为主要方法进行MR分析.使用TCGA分析TRIM31 在HCC中的表达,并利用CIBERSORT算法分析TRIM31 表达与免疫细胞浸润的相关性,ROC曲线评估诊断准确性.使用TCGA数据库进行高和低TRIM31 表达组之间的差异基因表达分析,并进行GO富集、KEGG通路富集和基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA).结果 MR分析结果显示,肝脏TRIM31 表达与NAFLD[OR=0.98,95%CI(0.91,1.05),P=0.515]、NASH[OR=0.98,95%CI(0.74,1.29),P=0.868]、肝 纤 维 化[OR=1.35,95%CI(0.84,2.17),P=0.218]、肝硬化[OR=1.06,95%CI(0.95,1.17)P=0.292]均不存在显著关联;与HCC[OR=1.26,95%CI(1.07,1.49),P=0.007]存在显著关联.TCGA数据分析显示,HCC组织中TRIM31 mRNA水平显著增加(P＜0.001).ROC分析显示,TRIM31 在HCC诊断中的曲线下面积为 0.794[95%CI(0.738,0.851)].高TRIM31 表达与免疫评分增加以及活化记忆CD4+T细胞、滤泡辅助性T细胞、调节性T细胞的比例增加相关,而与单核细胞和M2 型巨噬细胞比例减少相关.GSEA分析显示,TRIM31 高表达的HCC样本中显著富集与肿瘤恶性进展密切相关的信号通路,包括生物氧化信号通路(FDR＜0.05,NES=2.329)、钙信号传导通路(FDR＜0.05,NES=2.283)等.结论 肝脏TRIM31 表达上调可能增加HCC患病风险,可能与肿瘤免疫微环境的调控有关,为HCC发病机制的研究提供理论依据.
关键词：孟德尔随机化三重基序蛋白31慢性肝病肝细胞癌生物信息学
分类号：R575.2(消化系及腹部疾病)R735.7(消化系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(82374546)苏州市姑苏卫生人才计划人才科研项目(GSWS2021048)江苏省中医药科技发展计划项目(MS2024079)江苏省卫生健康委医学科研项目(M2024049)苏州市科技发展计划(基础研究-医学应用基础研究)项目(SKY2023218)
论文发表日期：2025-03-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 303-311,前插8-前插9 )
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