NEDD4L作为骨肉瘤预后标志物的生物信息学研究
刘懿天1
庄然2
丁勇3
1.空军军医大学唐都医院骨科,陕西西安710038;空军军医大学基础医学院免疫学教研室,陕西西安7100322.空军军医大学基础医学院免疫学教研室,陕西西安7100323.空军军医大学唐都医院骨科,陕西西安710038
摘要:目的 通过生物信息学方法筛查骨肉瘤(OS)患者与健康人骨组织的差异表达基因(DEGs)并进行筛选,构建OS患者的预后预测模型,为OS的预后评估提供潜在的生物标志物.方法 基于公共数据库获得OS的DEGs,构建单因素及多因素Cox回归分析预后模型,绘制生存曲线并使用ROC曲线评估预后模型效果,使用蛋白质印迹和组化染色在蛋白水平检测表达格局.结果 本研究在OS患者与健康人骨组织中共筛选出2 806个DEGs;单因素Cox回归分析显示,其中9个基因是总生存时间的独立危险因素(P<0.05);以神经前体细胞表达发育下调样基因4(NEDD4L)为主的多因素Cox回归分析ROC曲线1、3、5年AUC分别为0.76、0.84、0.86,单因素Cox回归分析AUC分别为0.78、0.72、0.72;在肿瘤微环境分析中NEDD4L表达量与肿瘤纯度显著正相关(R=0.35,P=0.001 0),在基因集富集分析中低表达NEDD4L与多种肿瘤相关通路有关;蛋白质印迹和组化染色均提示NEDD4L在OS中低表达.结论 低表达NEDD4L与OS的不良预后存在紧密联系,构建了稳定的NEDD4L单因素与多因素预后预测模型,可为临床OS患者的预后评估提供参考.
关键词:NEDD4L骨肉瘤生物信息学Cox回归分析
分类号:R738.1(运动系肿瘤)Q811.4(仿生学)
资助基金:国家自然科学基金(30973039)陕西省科学技术发展研究计划项目(2020SF-094)
论文发表日期:2023-01-28
在线出版日期:2026-08-26(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 74-81 )
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空军军医大学学报

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AMI
ISSN:2097-1656
年,卷(期):2023,44(1)
所属栏目:基础医学