基于网络药理学分析藤黄酸治疗牙周炎的分子机制
曹晓
冯艳青
付子波
陈珊
中山大学第一附属医院口腔科,广东 广州 510062
摘要：目的 应用网络药理学和分子对接技术探讨藤黄中主要成分藤黄酸(GA)在牙周炎治疗中的作用及分子机制.方法 使用SwissTargetPrediction、SEA及SuperPred数据库获取GA的相关靶点;利用GeneCards、DisGeNET及CTD数据库获取牙周炎的相关靶点;通过构建韦恩图获取药物和疾病的共同靶点;将共同靶点上传至STRING在线平台构建共同靶点"蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络",并运用Cytoscape 3.10.0软件对PPI网络进行可视化处理并筛选出关键靶点;使用Metascape数据库对关键靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析,并构建"KEGG通路-关键靶点"网络图;通过PDB数据库获取药物关键靶点度值前10的靶点蛋白pdb文件,使用AutoDock4软件进行分子对接.结果 获得"药物-疾病"共同靶点185个,包括STAT3、CASP3、TLR4、HIF1-α、MTOR、STAT1、ITGB1、HDAC1、ITGB3、CASP8 等核心靶点;KEGG 分析共获得 141 条信号通路,包括中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)形成、PI3K-AKT、Toll样受体等多条信号通路;分子对接结果显示GA与对应关键靶点结合能均≤-5 kJ/mol,药物结合能力较好.结论 GA可通过参与NETs形成、PI3K-AKT、Toll样受体等通路,调节免疫反应、炎症反应、组织修复,发挥对牙周炎的治疗作用.
关键词：牙周炎藤黄酸网络药理学分子对接
分类号：R285(中药学)R780.1(口腔疾病的预防与口腔卫生)
资助基金：广东省基础与应用基础研究项目(2020A1515110800)
论文发表日期：2024-10-28
在线出版日期：2026-08-26（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1123-1128 )
英文信息