ELOVL3在预测肝细胞癌预后中的作用
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1.新疆维吾尔自治区人民医院肝胆外科,乌鲁木齐 8300112.新疆维吾尔自治区人民医院病理科,乌鲁木齐 8300113.新疆第二医学院临床医学院,克拉玛依 834000
摘要：目的 探索精准预测肝细胞癌患者预后的分子标志物.方法 在TCGA数据库下载肝细胞癌(LIHC)样本的mRNA表达数据及相应的临床预后数据,并且收集从2017年1月1日至2022年1月1日在新疆维吾尔自治区人民医院接受肝切除手术的91例肝细胞癌(HCC)患者的临床病理资料和随访资料.用R软件筛查差异表达基因(DEGs)后,进一步进行Cox单变量回归分析和LASSO回归分析筛出与HCC患者生存相关的风险基因;用R软件的ggplot2分析包和免疫组织化学染色法分析ELOVL3在不同肝组织上的表达情况,Survival分析包实现Kaplan-Meier生存分析.结果 初步筛查得到752个DEGs,包括表达上调的247个基因和505个下调基因.进一步通过Cox回归分析得出175个与HCC患者的生存显著相关的基因集,LASSO回归分析,挑出14个与HCC患者生存密切相关的风险基因.最终通过预实验和文献调研将目标基因确定为ELOVL3.TCGA-LIHC的分析结果显示:ELOVL3在癌组织中的表达量明显高于正常肝组织(P＜0.001),而且该基因在癌组织中的表达量也高于互相匹配的癌旁组织(P＜0.001).免疫组化染色结果提示:ELOVL3在59例(64.8％)患者的肝癌组织中表达阳性,而32例(35.2％)患者的肝癌组织中没有表达;在互相匹配的癌旁组织中表达均为阴性.生存分析结果显示ELOVL3阳性患者的5年生存率明显比ELOVL3阴性患者低(r=0.028);ELOVL3高表达的患者总体生存率相对于ELOVL3低表达的患者低,而且表达量越高,预后越差(HR=1.7,P=0.008).结论 ELOVL3的表达与HCC患者的不良预后相关,而且具有做预测HCC预后的新型分子标志物的潜力.
关键词：肝细胞癌TCGA数据库差异表达基因预后
分类号：R737.3(泌尿生殖器肿瘤)
资助基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金(2023D01C225)新疆维吾尔自治区人民医院院内项目(20210207)
论文发表日期：2024-08-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 756-761 )
英文信息