N/Q比值对淋巴瘤甲醛固定石蜡包埋穿刺样本二代测序质控参数的影响
李三恩
阎萌
张昊
杨红丽
苏州大学附属第一医院 病理科,苏州 215006
摘要：目的 探究N/Q比值对淋巴瘤甲醛固定石蜡包埋穿刺标本二代测序(NGS)质量参数的影响.方法 收集苏州大学附属第一医院病理科采用杂交捕获法二代测序技术进行基因检测的 153 例淋巴瘤甲醛固定石蜡包埋(FFPE)穿刺标本的病理资料.根据核酸N/Q比值将标本分为 0＜N/Q＜2、2≤N/Q＜4、N/Q≥4 三组,比较三组样本间测序质量参数、平均特异性测序深度、平均测序深度、测序通过率的差异.结果 三组样本间的预文库总量、文库多样性、序列回贴比、平均特异性测序深度差异具有统计学意义(P＜0.05);其余各质量参数无明显差异.结论 评估淋巴瘤FFPE穿刺样本N/Q的比值有助于NGS质控参数的解读.
关键词：N/Q比值甲醛固定石蜡包埋二代测序质控参数穿刺样本
分类号：R446.9(诊断学)
资助基金：国家自然科学基金(82100268)苏州市科教兴卫青年科技项目(KJXW2022008)
论文发表日期：2024-10-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 996-998,1001 )
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