骨关节炎患者滑膜组织miRNA-mRNA相互调控网络及分子作用机制的研究
徐扬
吴驷东
钱臣
朱斌杰
213000 常州,江苏大学附属武进医院骨科、徐州医科大学武进临床学院
摘要：目的 通过生物信息学分析明确骨关节炎患者滑膜组织内miRNA-mRNA调控网络及分子机制.方法 miRNA和mRNA数据均来源于基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO),利用R 4.0.3筛选出差异表达的miRNA和mRNA,通过GO富集分析明确差异基因主要富集的细胞组分、生物学进程以及分子功能,KEGG富集通路分析明确差异基因主要富集的信号通路.通过FunRich 3.1.3对差异表达的miRNA进行靶基因预测,预测靶基因与差异表达mRNA进行Venn图绘制获取共同差异基因,基于miRNA和共同差异基因构建miRNA-mRNA调控网络.结果 GSE55457通过基因芯片技术检测健康患者滑膜以及骨关节炎患者滑膜的基因表达,GSE126677通过RNA测序技术检测健康患者滑膜以及骨关节炎患者滑膜的miRNA表达.最终通过数据分析共获得113个显著下调的差异表达mRNA、761个显著上调的差异表达mRNA;9个显著上调的差异表达miRNA、62个显著下调的差异表达miRNA.功能富集分析显示差异表达的mRNA参与细胞组分、生物学进程以及分子功能的功能调控;KEGG富集通路分析显示差异表达的mRNA主要参与整合素的调控、细胞生长因子的调控等多个信号通路.通过FunRich 3.1.3获得差异表达miRNA的预测靶基因并与本研究中差异表达的mRNA取交集后共获得9个差异表达的miRNA以及19个对应的mRNA,基于miRNA与mRNA之间的相互调控关系成功构建miRNA-RNA的调控网络.结论 通过构建骨关节炎患者滑膜组织的miRNA-mRNA的相互调控网络,初步明确了骨关节炎患者滑膜组织病理变化的具体分子机制,为后续骨关节炎的诊断、治疗提供潜在的分子靶点.
关键词：骨关节炎滑膜生物信息学分析ceRNA
分类号：R684.3(骨科学（运动系疾病、矫形外科学）)
资助基金：江苏省常州市武进区科技局科技计划(社会发展)项目(WS202013)
论文发表日期：2022-05-19
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 345-351 )
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