m6A修饰基因YTHDF2和 FMR1评估绝经后骨质疏松症风险可行性研究
杨树月1
蒲林莉2
颜文定3
魏丹蕾4
1.510000 广东省,广州中医药大学2.570206 海南省,海口市中医医院内分泌科3.510000 广东省,广州中医药大学附属广州中医医院骨科4.510000 广东省,广州中医药大学附属广州中医医院内分泌科
摘要：目的 基于微阵列、单细胞 RNA 测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)和临床队列评估绝经后骨质疏松症(postmenopausal osteoporosis,PMOP)中 N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰基因表达特征.方法 选取我院 2023 年 3 月至 2024 年 3 月接受骨密度检查绝经女性作为研究对象.根据倾向性评分匹配法均衡年龄、绝经年限和体质量指数(body mass index,BMI)变量后按 1∶1 入组,最终 PMOP 组和对照组各纳入 86 例.基于微阵列 GSE13850、GSE56815 和 GSE56814 以及 scRNA-seq 数据集 GSE147287 探索 m6A 修饰基因表达特征和分布.使用逆转录定量聚合酶链反应(reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)和蛋白免疫印迹验证 4 个 m6A 修饰基因 IGFBP3、YTHDF2、FMR1 和 RBM15 在中性粒细胞中表达特征.使用酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)检测和评估血浆YTHDF2 和 RBM15 中的表达特征.通过 Pearson 检验分析评估血浆 YTHDF2 和 RBM15 表达与骨矿物质密度(bone mineral density,BMD)相关性.通过接收者操作特性(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估血浆 YTHDF2 和 RBM15 诊断 PMOP 的准确性.结果 微阵列分析结果显示 IGFBP3 在 PMOP 中均表达上调(P<0.05),YTHDF2、FMR1 和 RBM15 在 PMOP 中均表达下调(P<0.05).YTHDF2 在多种细胞中表达,但主要表达于中性粒细胞和成骨细胞中,RBM15 主要表达于中性粒细胞,IGFBP3 和 FMR1 在 9 种细胞均少量表达.RT-qPCR 和蛋白免疫印迹结果显示 PMOP 中性粒细胞中 YTHDF2 和 RBM15 表达量均降低(P<0.05).相较于对照组,PMOP 组中血浆 YTHDF2 和 RBM15 表达量显著降低(P<0.05).YTHDF2 与腰椎(lumbar spine,LS)_BMD(r=0.306)和股骨颈(femoral neck,FN)_BMD(r=0.258)呈正相关性(P<0.05);RBM15 与LS_BMD(r=0.551)和 FN_BMD(r=0.426)呈正相关性(P<0.05).血浆 YTHDF2 和 RBM15 诊断 PMOP 的曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为 0.913(0.869～0.957)和 0.896(0.846～0.946).结论 m6A 修饰基因 YTHDF2 和 FMR1 在 PMOP 中表达降低、通过评估和定位 YTHDF2 和 FMR1 表达特征能为 PMOP 风险评估和治疗提供新见解.
关键词：基因修饰骨质疏松绝经后骨密度微阵列分析序列分析
分类号：R681(骨科学（运动系疾病、矫形外科学）)
资助基金：海南省南海新星医疗卫生人才平台项目(NHXX-WJW-2023024)
论文发表日期：2024-10-19
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 840-847 )
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