脓毒症潜在相关基因的生物信息学分析及功能预测
杨梦霞1
赵春铭1
陈腾飞2
徐霄龙3
刘清泉3
1.100010 北京,首都医科大学附属北京中医医院;100029 北京,北京中医药大学研究生院2.100010 北京,首都医科大学附属北京中医医院3.100010 北京,首都医科大学附属北京中医医院;100010 北京,首都医科大学中医脓毒症临床诊疗与研究中心
摘要：目的 通过生物信息学方法筛选并分析与脓毒症相关的差异表达基因及关键(Hub)基因,以期为临床诊疗提供潜在靶点和生物标志物.方法 使用基因表达综合数据库(GEO)筛选脓毒症基因表达数据集,运用GEO自带在线分析工具(GEO2R)分析差异表达基因(DEGs);并结合STRING 12.0 和DAVID数据库对DEGs进行富集分析;再通过Cytoscape 3.9.1软件筛选出Hub基因,并对其进行功能分析.结果 筛选出 328 个DEGs,其中上调基因 2 个,下调基因326 个.富集结果显示,DEGs的功能主要与蛋白质修饰、分解代谢、蛋白酶复合物、线粒体及酶活性等有关.通过CytoHubba插件筛选出了核因子κB亚基1(NFKB1)、NEDD8、人NADH-泛醌氧化还原酶 A8(NDUFA8)、POLR2F、延伸蛋白 B(ELOB)、PSMB6、SEC61A1、COX4I1、人NADH-泛醌氧化还原酶B8(NDUFB8)及ATP5PD 10 个Hub基因,经生物过程(BP)可视化发现这些Hub基因在生物过程中相互作用.结论 NFKB1、NEDD8、NDUFA8、POLR2F、ELOB、PSMB6、SEC61A1、COX4I1、NDUFB8 及ATP5PD等10 个Hub基因可能是脓毒症诊疗的潜在靶点和新型生物标志物,但部分基因对脓毒症发生发展的作用机制研究相对不足,仍需后续进一步验证.
关键词：脓毒症生物信息学分析差异表达基因(DEGs)Hub基因生物标志物
资助基金：国家中医药管理局中医药重点学科建设(zyyzdxk-2023001)
论文发表日期：2024-03-10
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 233-238 )
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