基于生物信息学分析甲型H1N1流感病毒性肺炎的生物标志物
杨梦霞1
李亚可2
陈腾飞2
徐霄龙3
刘清泉4
1.100010 北京,首都医科大学附属北京中医医院;100029 北京,北京中医药大学研究生院2.100010 北京,首都医科大学附属北京中医医院3.100010 北京,首都医科大学附属北京中医医院;100010 北京,首都医科大学中医脓毒症临床诊疗与研究中心;100010 北京,北京市中医药研究所4.100010 北京,首都医科大学附属北京中医医院;100010 北京,首都医科大学中医脓毒症临床诊疗与研究中心
摘要：目的 通过基于基因表达综合(GEO)数据集的生物信息学方法筛选和分析甲型H1N1流感病毒性肺炎的潜在生物标志物.方法 从GEO数据库获取甲型H1N1流感病毒性肺炎的数据集,并筛选差异表达基因,使用STRING 12.0数据库和Cytoscape 3.9.1软件对这些差异表达基因进行分析并筛选出Hub基因,使用DAVID数据库对这些差异表达基因进行功能富集分析.结果 筛选出1 019个差异表达基因,其中上调基因522个,下调基因497个.富集结果显示,这些差异表达基因的功能主要富集于细胞质、蛋白质磷酸化、免疫应答、补体成分、激酶活性、T细胞受体信号通路及FoxO信号通路等.最终确定了 CDK1、CCNA2、CCNB2、CDC20、TOP2A、KIF20A、DLGAP5、BUB1、KIF11和TPX2为Hub基因.结论 本研究阐明了 10个Hub基因(CDK1、CCNA2、CCNB2、CDC20、TOP2A、KIF20A、DLGAP5、BUB1、KIF11 和 TPX2)有可能作为甲型H1N1流感病毒性肺炎诊断和治疗的潜在生物标志物,但仍需更多的实验来进一步探索这些Hub基因在甲型H1N1流感病毒性肺炎中的具体机制.
关键词：甲型H1N1流感病毒性肺炎差异表达基因生物标志物生物信息学
资助基金：国家自然科学基金(82141202)国家中医药管理局中医药重点学科建设(zyyzdxk-2023001)
论文发表日期：2024-09-10
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 801-807 )
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