星形细胞瘤的基因表达谱和Hierarchical聚类研究
陈菊祥1
卢亦成1
楼美清1
胡国汉1
骆纯1
袁国良1
蔡茹钰1
应康2
谢毅2
1.第二军医大学附属长征医院神经外科,上海,2000032.复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室,上海,200433
摘要:目的探讨人脑星形细胞瘤发生发展中相关基因及分类特征基因的表达.方法用含13939种人基因的BioStarH140S芯片,以正常脑及18例胶质瘤组织总RNA制备的探针杂交芯片,ScanArray 4000扫描信号,提取脑及不同级别星形细胞瘤的差异基因并行生物信息分析,Hierarchical聚类提取差异基因的特征.结果星形细胞瘤中筛选出438条(3.14%)差异表达基因;信息分析与细胞信号、细胞骨架和运动、癌基因及抑癌基因等多类基因密切相关;与分类相关的特征基因有MAP7、DBCCR1、PCDHA5、KCNABl、NAP1L2等.表达谱将星形细胞瘤分成两类,与临床组织病理分类基本一致.结论芯片是基因分析和筛选肿瘤标志性基因的有效手段,可客观分析星形细胞瘤发展及预后;分类特征基因为星形细胞瘤侵袭性和预后判断提供依据,有助于临床诊治.
关键词:星形细胞瘤基因芯片表达谱Hierarchical 聚类
分类号:R739.41(神经系肿瘤)Q786(基因工程(遗传工程))
资助基金:国家自然科学基金(30100192)上海市科委项目(034119835)
论文发表日期:2004-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 97-101 )
英文信息展开
中国临床神经外科杂志

中国临床神经外科杂志

CSTPCD
ISSN:1009-153X
年,卷(期):2004,9(2)
所属栏目:论著