重型颅脑损伤病人外周血miRNA生物信息学分析
顾浩1
冯东福2
1.201900上海,上海交通大学医学院附属第九人民医院神经外科2.201900上海,上海交通大学医学院附属第九人民医院神经外科;201900上海,上海交通大学医学院创伤医学研究所
摘要：目的 通过生物信息学方法分析重型颅脑损伤(sTBI)病人外周血微小RNA(miRNA)的靶基因及功能.方法 从GEO数据库中检索获取sTBI病人和对照组外周血的基因芯片数据,应用生物信息学方法筛选差异表达的miRNA,并进行靶基因预测和生物学功能及信号通路分析,构建miRNA及靶基因的调控网络.结果 检索得到芯片GSE21854,筛选得到145个差异表达的miRNA,预测得到靶基因共580个.这些靶基因的功能主要为细胞增殖负性调控、转换生长因子β 受体信号通路负性调控等,主要分布在Ras信号通路、转换生长因子β 信号通路等.miRNA及靶基因的调控网络图显示hsa-miR-125a-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-217、hsa-miR-199a-3D、hsa-miR-543是调控核心.结论 sTBI病人外周血存在差异性表达的miRNA,hsa-miR-125a-5p、hsa-miR-760、hsa-miR-217、hsa-miR-199a-3p、hsa-miR-543与sTBI的进展密切相关.
关键词：重型颅脑损伤微小RNA外周血生物信息学
分类号：R651.1+5(外科学各论)Q786(基因工程（遗传工程）)
资助基金：国家自然科学基金(81772059)
论文发表日期：2019-12-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 749-751 )
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