iTRAQ技术检测烟雾病病人硬脑膜特异性蛋白表达
张小军1
尹林2
刘思远3
张丽军2
1.200331上海,上海天佑医院神经外科;200052上海,中国人民解放军海军第九○五医院神经外科2.201508上海,上海市公共卫生临床中心新药临床研究中心3.201400上海,上海师范大学信息与机电工程学院
摘要：目的 优化硬脑膜蛋白质的提取方法,筛选烟雾病(MMD)病人硬脑膜特异性表达蛋白质.方法 收集96例MMD和13例非MMD病人的硬脑膜组织,用胶原酶Ⅳ孵育去除硬脑膜表面的血液,用机械破碎或液氮研磨方法提取蛋白质,一维凝胶电泳分离后进行质谱鉴定,用同位素相对标记与绝对定量(iTRAQ)技术进行标记、分离和鉴定差异蛋白质,应用R语言和生物信息学分析筛选MMD相关蛋白质,再应用组织芯片技术验证差异蛋白质表达.结果 胶原酶Ⅳ消化、液氮研磨和十二烷基硫酸钠法提取硬脑膜蛋白质效果较好;iTRAQ技术和生信分析发现23个差异蛋白质,组织芯片结果证实MMD病人硬脑膜组织SLC4A1蛋白表达明显下调.结论 iTRAQ技术可以很好地进行标记、分离和鉴定硬脑膜组织差异蛋白质,SLC4A1可能在MMD发病过程中具有一定的作用.
关键词：烟雾病硬脑膜蛋白质组生物信息学组织芯片同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ)
分类号：R743(神经病学与精神病学)Q786(基因工程（遗传工程）)
资助基金：重大新药创制"科技重大专项(2017ZX09304027)
论文发表日期：2021-04-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 261-265 )
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