胶质瘤自噬相关长链非编码RNA的生信分析
李占成
石铁
周卫忠
067000河北承德,承德医学院附属中医院(承德市中医院)神经外科
摘要：目的 探讨胶质瘤自噬相关长链非编码RNA(lncRNA).方法 应用生信分析方法,首先检索CGGA和自噬基因列表来自人类自噬数据库(HADb),构建自噬相关lncRNA共表达网络;第二,多因素Cox回归分析胶质瘤预后相关的自噬相关ln-cRNA,并根据预后lncRNA计算风险评分,将胶质瘤分为低危组和高危组,采用生存曲线分析风险评分与胶质瘤预后的关系;最后,应用TCGA数据库进一步验证.结果 CGGA数据库筛选出879个lncRNA,HADb数据库筛选出216个自噬基因,构建出含402个lncRNA自噬相关lncRNA共表达网络;多因素Cox回归分析筛选出10个与胶质瘤病人预后有关的自噬相关lncRNA,而且根据这些lncRNA计算出的风险评分是胶质瘤病人预后的独立影响因素(P＜0.05);生存曲线分析显示低风险组中位生存时间(1211d)较高风险组(346d)明显延长(P＜0.05).TCGA数据集共纳入160例胶质母细胞瘤(GBM),多因素Cox回归分析显示,风险评分是GBM独立预后影响因素(P＜0.05);生存曲线分析显示低风险组中位生存时间(468 d)较高风险组(385 d)明显延长(P＜0.05).结论 多个自噬相关lncRNA与胶质瘤预后相关,提示调控自噬相关lncRNA对胶质瘤具有潜在的治疗作用.
关键词：胶质瘤细胞自噬长链非编码RNA预后
分类号：R739.41(神经系肿瘤)Q786(基因工程（遗传工程）)
论文发表日期：2021-11-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 839-841 )
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