颅内动脉瘤破裂关键基因的生信分析
武朋磊
吴赞
孟繁成
杨廷舰
261000山东潍坊,潍坊医学院附属医院神经外科
摘要:目的 探讨颅内动脉瘤破裂的关键基因.方法 采用生信分析方法,GEO数据库下载数据集GSE13353、GSE15629、GSE54083,R语言筛选差异表达基因(DEG),WGCNA算法分析动脉瘤破裂关键基因,采用GO和KEGG分析关键基因的生物学功能,GSEA软件进行基因富集分析.应用GSE122897数据集进行验证.结果 共筛选出49个DEG,其中28个上调,21个下调.WGCNA算法、GO和KEGG分析结果显示,颅内动脉瘤破裂主要与炎症和免疫反应有关.枢纽基因和关键基因筛选显示,VNN2和CXCR4在颅内动脉瘤破裂过程中起重要作用.结论 我们使用WGCNA的3个GEO数据集构建破裂和未破裂动脉瘤的共表达网络,筛选出介导颅内动脉瘤破裂的关键基因,这些关键基因与炎症和免疫反应密切相关.这提示炎症和免疫反应可能在颅内动脉瘤破裂过程中起重要作用.
关键词:颅内动脉瘤WGCNA算法生物信息学基因表达
分类号:R743.9(神经病学与精神病学)Q786(基因工程(遗传工程))
论文发表日期:2022-02-25
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 95-99,103 )
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中国临床神经外科杂志

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ISSN:1009-153X
年,卷(期):2022,27(2)
所属栏目:论著