胶质母细胞瘤铜死亡相关lncRNA预后模型的构建
邓云良
643000 四川,自贡市第四人民医院神经外科
摘要：目的 采用生物信息学方法分析胶质母细胞瘤差异表达的铜死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)并构建预后模型.方法 计算机检索TCGA数据库下载胶质母细胞瘤的RNA-seq数据及其临床信息,应用单因素Cox分析和LASSO回归筛选铜死亡相关lncRNA,并计算风险评分=基因系数×基因表达量,以风险评分中位数分为低风险组和高风险组;将胶质母细胞瘤样本随机分为测试组和训练组,再进行整合生物信息学分析.结果 共下载胶质母细胞瘤样本169例,对照样本5例,共表达分析发现791个铜死亡相关lncRNA,其中正相关lncRNA有753个,负相关lncRNA有38个.单因素Cox分析发现22个显著差异表达的ln-cRNA(P<0.05),LASSO回归分析筛选9个差异表达的lncRNA;多因素Cox回归分析显示风险评分增高是胶质母细胞瘤预后不良的独立危险因素(P<0.05).生存曲线分析显示,无论是训练组,还是测试组,高风险组总体生存期和无进展生存期显著缩短(P<0.05).ROC曲线分析显示模型对1、2、3年生存期具有良好的预测价值(P<0.05),而且风险评分预测效能显著优于其他临床信息(P<0.05).结论 本文通过生物信息学方法成功构建胶胶质母细胞瘤铜死亡相关lncRNA的预后模型,该模型对胶质母细胞瘤的预后具有良好的预测价值.
关键词：胶质母细胞瘤铜死亡长链非编码RNA(lncRNA)预后
分类号：R739.41(神经系肿瘤)Q786(基因工程（遗传工程）)
论文发表日期：2023-04-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 255-258,262 )
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