胶质母细胞瘤氧化应激相关基因的表达分析
黄冠又1
张欣1
甘鸿川1
郝淑煜2
吴震2
1.550081 贵阳,贵州医科大学附属金阳医院神经外科2.100070 北京,首都医科大学附属北京天坛医院神经外科
摘要：目的 探讨胶质母细胞瘤(GBM)氧化应激关键基因的表达变化.方法 从UCSC Xena数据库下载167例GBM基因表达谱数据(TCGA-GBM),从GeneCards数据库下载氧化应激基因集(168个氧化应激相关基因);通过富集分析确定差异表达基因(DEGs),建立蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络识别关键基因,利用Spearman相关系数对免疫因子和免疫检查点与关键基因进行相关性分析.结果 鉴定出两种与氧化应激相关的GBM分子亚型(Cluster1和Cluster2),Cluster1型GBM生存期明显高于Clus-ter2型(P<0.05).共筛选出54个DEGs,在细胞因子/趋化因子相关功能中显著富集.PPI网络鉴定出10个关键基因,即CSF2、CSF3、CCL7、LCN2、CXCL6、MMP8、CCR8、TNFSF11、IL22RA2和ORM1.大多数免疫因子和免疫检查点与关键基因呈正相关.结论 本文基于氧化应激相关基因将GBM划分为两个亚型,并且筛选出10个氧化应激基因,可能在GBM的发生、发展过程中起重要作用,也可能对GBM预后评估具有一定的价值.
关键词：胶质母细胞瘤氧化应激基因表达
分类号：R739.41(神经系肿瘤)Q786(基因工程（遗传工程）)
资助基金：国家自然科学基金(81672506)国家自然科学基金(81872052)贵州省卫生健康委员会科学技术基金项目(gzwkj2022-348)
论文发表日期：2023-04-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 259-262 )
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