基于生信分析的脑胶质瘤预后模型的构建与验证
夏天1
金志勇2
于如同2
1.221000 江苏徐州,徐州医科大学附属医院神经外科/徐州医学大学神经系统疾病研究所;221300 江苏邳州,徐州医科大学附属邳州医院神经外科2.221000 江苏徐州,徐州医科大学附属医院神经外科/徐州医学大学神经系统疾病研究所
摘要:目的 探讨脑胶质瘤预后模型的构建方法及预测效果.方法 从CGGA数据库获得脑胶质细胞瘤的样本数据,进行差异表达基因(DEGs)分析及加权基因共表达网络分析(WGCNA),获得关键基因,采用Lasso-Cox方法分析有效关键基因并计算风险评分,生存曲线分析风险评分与脑胶质瘤生存预后的关系,多因素Cox回归和列线图分析构建预后模型,并使用TCGA数据库验证.结果 共发现5463个DEGs,其中4697个显著上调,766个显著下调.WGCNA分析筛选出261个关键基因,Lasso-Cox分析得到11个有效关键基因,并计算风险评分.根据风险评分中位数将脑胶质瘤分为高、低风险组,生存曲线分析显示,高风险组脑胶质瘤病人中位生存期较低风险组明显缩短(P<0.001).多因素Cox回归分析显示风险评分是脑胶质瘤预后危险因素.利用WHO级别、复发状态、IDH情况、年龄、化疗及风险评分构建预后模型预测1、3、5年生存预后ROC曲线下面积分别为0.76、0.82、0.84,预后模型的C-Index值为0.778,风险评分的C-Index值为0.74.结论 采用CGGA数据库中脑胶质瘤样本数据成功构建了预后模型,为临床判断脑胶质瘤预后具有一定的价值.
关键词:脑胶质瘤生信分析差异表达基因WGCNA预后模型
分类号:R742.8(神经病学与精神病学)R651.1+1(外科学各论)
论文发表日期:2023-08-25
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 504-507,512 )
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中国临床神经外科杂志

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ISSN:1009-153X
年,卷(期):2023,28(8)
所属栏目:论著