人E1A激活基因阻遏子基因启动子生物信息学分析及转录调控功能初探
韩雅玲
赵昕
闫承慧
康建
张效林
邓捷
徐红梅
刘海伟
1.沈阳军区总医院全军心血管病研究所心内科,辽宁,沈阳,1100162.沈阳军区总医院全军心血管病研究所心内科,辽宁,沈阳,1100163.沈阳军区总医院全军心血管病研究所心内科,辽宁,沈阳,1100164.沈阳军区总医院全军心血管病研究所心内科,辽宁,沈阳,1100165.沈阳军区总医院全军心血管病研究所心内科,辽宁,沈阳,1100166.沈阳军区总医院全军心血管病研究所心内科,辽宁,沈阳,1100167.沈阳军区总医院全军心血管病研究所心内科,辽宁,沈阳,1100168.沈阳军区总医院全军心血管病研究所心内科,辽宁,沈阳,110016
摘要:目的 对人类腺病毒5型早期区域1A(adenovirus type 5 early region 1A,E1A)激活基因阻遏子基因(cellular repressor of E1A-stimulated genes,hCREG)启动子进行生物信息学分析、预测hCREG启动子位置和转录因子结合位点.方法 对2005年1月至7月沈阳军区总医院全军心血管病研究所进行的从Genbank中获得hCREG的全长编码基因,利用First EF程序分析软件分析并获得hCREG的启动子序列,利用Motif软件对启动子序列中的转录因子结合位点进行预测.免疫荧光染色和Western blot分别观察相关转录因子的蛋白表达与细胞内hCREG蛋白及细胞表型转化之间的关系.结果 用First EF软件测定长度为945 bp的hcREG启动子序列,hCREG的启动子区可能定位于转录起始点上游-109~-359 bp.用Motif软件预测启动子区域共含有80多个转录调控因子结合位点,其中肿瘤抑制基因wtp53结合位点为-456 bp.进一步应用蛋白质印迹(western blot)和免疫荧光染色分析wtpS3与细胞表型转化的关系.在0.5%胎牛血清(fetal bovine serum,FBS)培养的HITASY细胞wtp53表达较10% FBS培养HITASY细胞明显增加.同时,hCREG蛋白和平滑肌细胞分化标志蛋白SM α-actin亦表达增多.结论 获得了hCREG启动子的转录调控信息,推测出wtp53是hCREG基因转录的重要调控因子,它可能结合于hCREG启动子区,参与hCREG蛋白对VSMCs表型转化的调控.
关键词:启动子生物信息学wtp53阻遏蛋白E1A表型
分类号:R5(内科学)
资助基金:国家自然科学基金(30570664)辽宁省自然科学基金(2050426)
论文发表日期:2007-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:3( 935-937 )
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