基于GEO数据库对甲状腺乳头状癌的靶基因分析研究
张丽平
刘婷婷
滕卫平
1.中国医科大学附属第一医院内分泌研究所,辽宁沈阳1100012.中国医科大学附属第一医院内分泌研究所,辽宁沈阳1100013.中国医科大学附属第一医院内分泌研究所,辽宁沈阳110001
摘要：目的 初步探索分析甲状腺乳头状癌中的差异microRNA及其靶基因,为甲状腺乳头状癌的研究及治疗提供新的思路.方法 从GEO数据库中查找适合的芯片,利用GEO2R在线网站及生物信息学分析软件进行差异的microRNA分析,并对符合筛选标准的microRNA及其靶基因进行GO和KEGG分析,筛选重要的microRNA及其靶基因.结果 (1)通过对芯片GSE73182及GSE 113629数据挖掘发现,差异的microRNA有1535个,符合纳入研究标准的差异microRNA为12个,其中,上调的microRNA为8个,下调的microRNA为4个.(2)差异的microRNA进行预测靶基因,得出关键的靶基因有44个,主要参与生物学调控、代谢、免疫应答、蛋白质结合等方面.(3)文章发现:hsa-miR-21-5p与靶标JAG1及SOX5、hsa-miR-181a与靶标PROX1、hsa-miR-204-5p与其靶标BCL2可能存在作用.结论 hsa-miR-21-5p与靶标JAG1及SOX5、hsa-miR-181a与靶标PROX1、hsa-miR-204-5p与其靶标BCL2有望成为新的研究方向.
关键词：甲状腺乳头状癌生物信息学差异靶基因基因芯片
分类号：R763.1(耳鼻咽喉科真菌病)
论文发表日期：2020-03-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 237-241 )
英文信息