基于转录组测序的西瓜果肉硬度相关基因表达分析
郑雪梦1
时月2
王雪敏3
马越2
赵晓燕4
张超4
1.北京市农林科学院蔬菜研究中心 北京 100097;河北工程大学 河北邯郸 0560062.北京市农林科学院蔬菜研究中心 北京 100097;果蔬农产品保鲜与加工北京市重点实验室 北京 1000973.河北工程大学 河北邯郸 0560064.北京市农林科学院蔬菜研究中心 北京 100097;农业农村部蔬菜产后处理重点实验室 北京 100097
摘要：以脆肉型'京欣3号'西瓜和硬肉型'甜王'西瓜为样品,评价果肉硬度表型差异,并利用转录组测序技术检测2个品种间差异表达基因.结果发现,'甜王'西瓜品种果肉硬度是'京欣3号'西瓜的1.9倍,表型与'京欣3号'西瓜具有显著性差异.转录组测序结果显示,与'京欣3号'西瓜相比,'甜王'西瓜样品有5342个基因差异表达,其中2360个基因上调表达,2982个基因下调表达.差异基因主要注释在碳水化合物代谢、信号转导、脂质代谢等途径,其中与果肉硬度变化的候选基因主要包括果胶酯酶、果胶裂合酶、聚半乳糖醛酸酶、纤维素酶、纤维素合酶、β-半乳糖苷酶、β-葡萄糖苷酶、酸性几丁质酶、几丁质酶、木葡聚糖内转葡糖基酶/水解酶和脂氧合酶基因.钙调蛋白、乙烯反应转录因子、乙烯不敏感样蛋白、WRKY转录因子、MYC2转录因子、过氧化氢酶、呼吸爆发氧化酶和脱落酸受体PYR1参与果肉细胞活动信号转导,可能与果肉硬度相关.
关键词：西瓜硬度转录组差异表达基因
分类号：S651(瓜果园艺)
资助基金：现代农业产业技术体系资助(CARS-25)北京市自然科学基金(6172013)北京市农林科学院协同创新中心(KJCX201915)
论文发表日期：2020-10-05
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 15-22 )
英文信息